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基因突变检测之Mutect2写在前面的话 今天是2021年1月3号，年底一番瞎忙活，停更了好长一段时间的简书。人生中有个很重要伯乐导师告诉我，在这个事多的工作环境下，没人愿...
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CNV变异分析软件介绍之DECoNCNV软件的介绍 最近在学习CNV检测软件，在查阅的时候发现有个软件比较测试的文章，大力推荐了DECoN，那我就去学习一下这个软件吧。先说说这个...
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CNV变异分析策略介绍
CNV简介： 拷贝数异常(copy number variations, CNVs)是属于基因组结构变异（structural variatio...
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TCGA 癌种对应关系
TCGA数据库中含有的癌症名称，简写和中文名称。 Cohort英文名称中文名称ACCAdrenocortical carcinoma肾上腺皮质癌...
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基因突变类型分类写在前面的话： 基因突变，指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。突变可以发生于编码序列，也可发生在启动子、内含子和剪切位点等非编码序列。...
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samtools flagstat 统计结果的理解
比对结束后，需要了解比对结果的情况，可以采用samtools flagstat进行统计samtools flagstat统计bam文件比对后每一...
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执念
就是想整出来，搞不懂为啥，魔怔了。哈哈哈
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修改pip 下载模块或软件的默认文件夹如果是源代码的话。也可指定安装路径。 回到pip。首先，我们先查看一下默认的安装地址。命令行为： 如下图所示：我们看见这里的USER_BASE ...
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【转载】【2017年】基于二代测序（NGS）的肿瘤panels验证指南
文章概要： NGS方法为使用单个平台检测多个体细胞变异提供了独特的优势，并成功地用于肿瘤标本中，用于预测靶向治疗反应，疾病诊断和预后。已经成为检...