发简信
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一致性基因组提取软件-ANGSD安装与使用
ANGSD软件可以基于比对好的bam文件，提取得到与比对用的参考基因组一致性的基因组，有了一致性基因组，可以根据对应参考基因组的gff3文件提取...
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phyluce软件安装与使用
超保守原件UCEs,(ultraconserved elements )，是在进化过程中，各个物种保留的一种保守序列，因此可以通过提取该类序列，...
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动物线粒体基因组注释软件MITOS2安装与使用
MITOS2可用于注释后生动物以及真菌等线粒体基因组注释，主要注释线粒体18个核心基因（atp6 atp8 atp9 cob cox1 cox2...
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PlantCARE预测植物启动子-顺式作用元件启动子 启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列，它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列，多数位于结构基因转...
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一些常用小脚本记录
记录下小编自己可能用到的小脚本 （1）fasta转phylip格式 用法：python fa2phy.py seq.fasta seq.ph...
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基因组及gff3注释下载总结对于生信分析，经常需要从各种网址下载基因组，小编在此分享一些下载经验， （1）参考文献：对于一个科学研究者，可以直接找到研究物种已发表的基因组文...
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hifiasm软件安装与使用
HiFi测序以及hifiasm软件的使用，目前是市场上二倍体动植物基因组组装的最佳选择，没有之一，多倍体目前也是最佳选择,也正因为HiFi跟hi...
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linux系统-界面配色分享
在linux系统创建新的账号后，界面显示基本上是黑白色的，这时需要添加显示的色彩，小编这里分享自己的界面配色： 将下面两行添加到~/.bashr...
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IBD分析软件germline安装与使用
Identity by Descent (IBD) ：同源相同片段，是在两个及以上个体存在来源于同一祖先的、未发生重组的、完全相同的DNA片段，...