240 发简信
IP属地:重庆
  • Resize,w 360,h 240
    Orthovenn2,搭建属于你的比较基因组学利器

    写在前面 近期抽空基于OrthoVenn2给SapBase新增了一个比较基因组方面的模块。OrthoVenn2可对多物种全基因组直系同源基因簇比...

  • Resize,w 360,h 240
    搭建PrimerServer2之Web UI界面

    写在前面 引物设计几乎是每个分子实验室的研究生必备的一项技能。目前,已经有许多成熟的引物设计软件供大家使用,如本地版的Primer5以及NCBI...

  • Resize,w 360,h 240
    Connected Papers,丰富你的知识储备

    写在前面 近期考研分数已经公布,9月份在各个科研领域又将注入一大波新鲜的科研血液。那么,初入茅庐的研究生新生,该如何快速并精确地掌握一个研究领域...

  • Resize,w 360,h 240
    什么?!听说你还在用viroBlast搭建本地Blast网站?快换成美美哒SequenceServer!

    写在前面 刚开始整数据库的时候,用过viroBlast搭建Blast服务,详见用viroblast搭建本地blast网站 - 简书 (jians...

  • Resize,w 360,h 240
    震惊!!KEGG官方工具能够完成任何物种的KEGG注释!!!

    写在前面 之前介绍过使用EggNOG-mapper对非模式物种快速完成KEGG注释的推文https://mp.weixin.qq.com/s/k...

  • Resize,w 360,h 240
    初探GitBook

    写在前面 硕士期间在折腾某些分析的时候,就发现好些软件的操作文档都是用GitBook写的,并且挂到网上供用户检索与浏览,实在是方便而又简洁好看 ...

  • Resize,w 360,h 240
    记录NCBI下载基因组的大坑

    写在前面 最近分析的物种由于国外品种与国内品种差异还是比较大,虽然大部分文章用的参考基因组都是以国外品种为主,但是由于考虑到目前我这边数据几乎全...

  • Resize,w 360,h 240
    下载公共测序数据的另一种姿势(kingfisher)

    写在前面 一般在进行公共测序数据挖掘的时候,需要从公共数据库中(SRA、ENA、DDBJ等)下载自己所需的测序数据。下载数据时,往往会遇到网速限...

  • Resize,w 360,h 240
    使用EGGNOG-Mapper对非模式物种快速进行GO或KEGG注释

    对于非模式物种,需要做GO或KEGG富集,可以尝试使用EGGNOG-Mapper来对你的物种序列进行快速注释。在注释结果文件中,可以同时获得序列...