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前言 此复现过程全程由kinesin老师指导,过程有点复杂,如发现问题,请及时简书联系我,我及时更改,主要复现标准化免疫细胞组成的生存分析。 下...
今天抽个空把单细胞领域的GO KEGG GSEA GSVA都做了一遍,跑完以后的感觉就是有这样的理解,就是单细胞我首先会选择做GSVA,但是我还...
我是用seraut自带函数作图的,当然很多人用ggplot做的更好看,再次提醒有人会用ggplot调好色的代码,记得简书发给我,我就用很蠢的自带...
tcga癌旁数据较少,所以有时候看配对数据的对比,更能代表基因在癌和癌旁的区别。
突变数据其实做的不多,代码什么的也较少,其实也比较简单,现在就整理了一下,然后得到了柱形图的代码,一并奉上。 下载数据 自带的包 ·#分组处理 ...
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以前一直用经典的MCP法分免疫浸润 总感觉不好 上篇文章上也写过 这次用肠癌单细胞6万多的细胞的特异性基因,特异性基因我是一个一个看的,我选的标...
下载TCGA FPKM数据 下载TCGA临床数据 XENA官网下载整合好的数据 整理表达矩阵 提取mRNA和gene名转换 表达矩阵和临床数据融...
简介 这是复现一篇结肠癌的文献图例,GSE4107,文献地址https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/...