在国内克隆GitHub项目时，有时候你会因为网络速度非常抓狂。尤其是你要用20kb的速度去下载一个200Mb的项目时，你会感受到什么叫做绝望。 ...
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Github上项目克隆速度太慢怎么办 -
GEO芯片数据下载及清洗获得平台探针注释信息 这个probe矩阵里就有详细的探针信息啦～其中第15行是gene_symbol，接下来会用到 获取表达谱数据和表型矩阵 这...
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强强联合的基因ID转换刘小泽写于2020.5.28Ensemble转Symbol其实不是这么简单，问题百出，需要留意 0 今天遇到一个需求，先来看看 有这样的四个文件...
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Bioconductor 分析芯片数据教程
这是我在 The Bioinformatics Knowledgeblog 上看到的一篇教程，原文在这里，教程条理清晰，对我理解芯片数据分析流程...
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如何使用GEOquery和limma完成芯片数据的差异表达分析如何分析芯片数据 我最早接触的高通量数据就是RNA-seq，后来接触的也基本是高通量测序结果而不是芯片数据，因此我从来没有分析过一次芯片数据，而...
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富集分析集锦搜罗了几篇富集分析的文章，把自己觉得特别好的在此集中展出，感谢各位作者！ 转自刘小泽，Enrich me! 不管是转录组，还是芯片数据，或者其他...
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生信-记一次NCBI-R语言-淋巴癌突变与未突变基因的差异分析关键词：基因芯片、R、筛选、预处理、差异分析 NCBI-淋巴癌突变与未突变基因的差异分析PS：好久没分享生信了，这是一年前做的一次生信task（...
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单样本基因集富集分析 --- ssGSEA1. 概述 单样本基因集富集分析（single sample gene set enrichment analysis, ssGSEA），是GS...
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TCGA-miRNA的生存分析引言：之前写了mRNA的生存分析，对于miRNA来说基本一致，只不过因为从TCGA上下载的miRNA的reads文件和mRNA有一点不一样，需要...
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GSE83521/GSE89143去除批次效应老大在群里出的题，说感觉这个热图很诡异，然后中间我自己没有用boxplot查看数据的表达量，对于数据不能有正确的认识，导致一开始的deg的log...
专题公告
GEO数据学习
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