白露：天气转凉，露凝而白。 Seurat Vignettes 显示不知道怎么设计的，有点bug。打开默认不会显示全部。 需要缩小才行 真可谓一...
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Seurat24节气之15白露---Seurat Vignettes -
Seurat24节气之16秋分---降维秋分：昼夜平分。 载入数据 此小插图演示了如何RunPCA在Seurat v3.0中存储降维信息（例如的输出）并与之交互。出于演示目的，我们将使...
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Seurat24节气之17寒露---scRNA-seq整合简介
寒露：露水以寒，将要结冰。 scRNA-seq整合简介 对两个或多个单细胞数据集的联合分析提出了独特的挑战。特别是，在标准工作流程下，识别多个数...
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Seurat24节气之18霜降---`Seurat` 对象互动
霜降：天气渐冷，开始有霜。 Seurat 对象互动 自Seurat v3.0起，我们对Seurat对象进行了改进，并增加了用于用户交互的新方法。...
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Seurat24节气之19立冬---meta.data
立冬：冬季的开始。 质量控制指标存储在Seurat中的什么位置？ 独特基因的数量和总分子在计算过程中自动计算 [CreateSeuratObje...
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Seurat24节气之20小雪---ScaleData可以加快速度吗
小雪：开始下雪。 缩放数据 接下来，我们应用线性变换（“缩放”），这是像PCA这样的降维技术之前的标准预处理步骤。该[ScaleData()](...
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Seurat24节气之21大雪---vars.to.regress = "percent.mt"排除线粒体基因
大雪：降雪量增多，地面可能积雪。 与Seurat v2中一样，如何删除不需要的变化来源？ 在其中，Seurat v2我们还使用该[ScaleDa...
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Seurat24节气之22冬至---saveRDS秒存冬至：寒冷的冬天来临。 运行非线性降维（UMAP / tSNE） Seurat提供了几种非线性降维技术，例如tSNE和UMAP，以可视化和探索这...
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Seurat24节气之23小寒---FeaturePlot常用绘图功能小寒：气候开始寒冷。 [https://satijalab.org/seurat/articles/visualization_vignette...
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Seurat24节气之24大寒---pbmc3k.final.no.umap[["umap"]] <- NULL吾尝终日而思矣,不如须臾之所学也.吾尝跂而望矣,不如登高之博见也.登高而招,臂非加长也,而见者远；顺风而呼,声非加疾也,而闻者彰.假舆马者,非利...
专题公告
学习 seurat
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