导读 Fastp能检测和去除adapter，PE序列overlap区碱基矫正，slide window修剪头尾，polyG/X尾修剪，UMI预处...
投稿
收录了9篇文章 · 13人关注
-
Fastp：过滤二代测序数据 -
用R语言对vcf文件进行数据挖掘.11 CNV分析目录 前言[https://www.jianshu.com/p/729673778e43] 方法简介[https://www.jianshu.c...
-
生信分析软件总结合集
持续更新中EDTA：TE 注释工具。是一个可以从头注释全基因组中的TE并且评估已有TE库注释优劣的工具包。该工具的主要步骤是过滤掉原始TE中注释...
-
63.《Bioinformatics Data Skills》之SAM文件格式(3)
上一节我们知道SAM文件有11列必要的信息，其中有3个信息分别为Bitwise Flag，CIGAR字符串与比对质量比较复杂，这里展开了解一下。...
-
跟着Nature Genetics学画图：R语言ggbio包画基因结构图论文是 Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cu...
-
【R>>MOVICS】多组学+亚型秘密武器MOVICS包整合多组学数据进行分析，其安装的过程太让人心酸，大家安装的过程慢慢体会，下面就来学习下这个由“大鱼海棠”老师开发的R包吧。 1.示...
-
35.《Bioinformatics Data Skills》之生物信息文本处理利器bioawk
作为表格文本处理命令awk的延伸，Heng Li开发了专门处理生物信息学的文件（例如bed, sam, vcf, gtf等）的命令bioawk，...
-
比对及变异检测工具的选择，基因组变异
1.序列比对 2.DNA-seq&RNA-seq 3.几款比对工具的比较 4.基因组变异 5.变异检测工具的选择 6.参考 序列比对 目前的生物...
-
Aspera工具安装与使用
在进行高通量分析的过程中，经常需要从NCBI或EBI下载动辄几十G的高通量数据，这东西，就算是神如迅雷，也是应付不了了，这个时候，为了加快传输速...
-
SRA 数据下载自救指南还在羡慕海峡那边的朋友下载SRA 快到飞起？还在难过用wget 下载数据经常下载不完整？用了官方的下载工具还是慢的不行？这里有一个SRA 下载自...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1687920/u_3729367752_2497112051_fm_200_gp_0.jpg', '推荐专题《生物信息软件》（ 分享自 @简书 ）','http://39.103.169.235/c/125c9bc4b334?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','页面编码gb2312|utf-8默认gb2312'));){kind=link}