hello，大家好，今天我们来分享一个做细胞通讯的分析软件NicheNet，这个软件最大特点就是预测配体活性，所以很多文章里都将NicheNet...
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10X单细胞（10X空间转录组）通讯分析之NicheNet -
转录组WGCNA分析介绍这个包之前，先要搞清楚这个包能干啥。（部分内容摘抄自学术咖） Q1：WGCNA能干嘛？A1：能够将表达模式相似的基因进行聚类，并分析模块与特...
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使用clusterProfiler进行GO、KEGG富集分析（有参情况）寻找差异表达的基因并识别它们的功能，是我们进行RNA测序的最主要目的。很明显，这些差异的基因必然与功能改变密切相关，例如，比较患病个体与正常个体...
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【R】clusterProfiler的GO/KEGG富集分析用法小结
前言 关于clusterProfiler这个R包就不介绍了，网红教授宣传得很成功，功能也比较强大，主要是做GO和KEGG的功能富集及其可视化。简...
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RNA-seq(7): DEseq2筛选差异表达基因并注释(bioMart)============================================写在前面：可以参考另外一篇《得到差异基因后怎么做？[ht...
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富集分析不光有条带图和点图，还有...参考资料 南方医科大学网红博导Y叔的一本神奇的书https://yulab-smu.github.io/clusterProfiler-book...
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单细胞RNA-seq去除批次效应这是一篇2018年发表在NBT上的文章，讲述的是两套单细胞数据如何去除批次效应 文章链接： 前言 由于不同的实验室，以及各个技术人员手法不同，在...
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从单细胞到空间转录组，生物医学进入新时代（转自 爱丽慕斯）编者按：随着10X genomics 于2019年11月发布Visium Spatial Gene Expression Solution，空间...
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零代码差异表达分析, DESeq,limma,edgeR一网打尽
作为一个生物学家(zha)，差异表达分析似乎是一项必备的技能。然鹅对于一个没有任何编程基础的生物学家，写代码是那么神秘莫测而又遥不可及，让人脑壳...
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2020-07-02 WGCNA 练习WGCNA基本概念 加权基因共表达网络分析（WGCNA）是一种系统生物学方法，用于样品中基因之间的相关模式。WGCNA可用于查找高度相关的基因的...
专题公告
生信分析
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