写在前面 生物信息数据下游分析，是一个非常复杂，且几乎没有也不可能流程化的操作。究其原因，但凡贴近生物学问题，需要更多生物学视角，甚至是研究人员...

在基因家族分析中，关于功能域可视化是一个相对比较简单的流程式方法。能够较好地了解不同物种间同一个家族结构域的保守和差异情况。单纯进行可视化的方法...

本文章将介绍 ①类blast软件blast、mmseqs、diamond、hmmer的比较 ②blast、mmseqs、diamond、hmme...

一、基因家族基础知识与研究思路介绍 1.基因家族简介 基因是染色体上一段可以发生转录的区域（内含子外显子启动子）。转录本才是基因的研究实体，转录...

遇到的问题：fungene上的氮循环基因narG.hmm数据太老 http://fungene.cme.msu.edu/ 如图共5条序列，一致的...

包括基因成员的序列特征分析（分子量等电点等）基于motif分析成员序列保守特征与可视化（蛋白与核酸，可用于挖掘未知，尤其是核酸水平-非编码水平的...

写在前面：非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具，作者详细讲解了基因家族的分析过程和意义，课程购买地址，讲的很棒，可以试听。 一共分为4...

方法一：基于hmm模型的鉴定方法 1.准备数据①下载拟南芥基因组fasta文件、注释文件gtf/gff3文件：ftp://ftp.ensembl...

此版本为无代码版本，依赖tbtools来实现，纯粹记录自己的学习经验。 蛋白序列的blast比对 选择拟南芥基因家族的蛋白序列文件 选择你想要查...