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收录了13篇文章 · 7人关注
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    使用clusterProfiler进行富集分析

    clusterProfiler是业界大神Y叔写的R包,看过了它的绘图就会使人沉迷于其颜值无法自拔。本文很多内容直接翻译自官方文档,加上了我的测试...

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    WGCNA分析,简单全面的最新教程

    本文应该是第二全的WGCNA分析教程,参考了最新的文档。第一全的还在路上,会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上,...

    14.4 生信宝典 123 286 1
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    用tbtools进行基因家族分析《一》

    此版本为无代码版本,依赖tbtools来实现,纯粹记录自己的学习经验。 蛋白序列的blast比对 选择拟南芥基因家族的蛋白序列文件 选择你想要查...

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    基因在染色体上位置可视化

    感谢CJ大神的反复修改,这个功能越变越好了!本文旨在复现CJ大神推文内容,具体请参考“省心炸鸡”,手动狗头(https://www.jiansh...

  • 差异分析之后——富集分析

    差异分析后可以得到基因表达的logFC值,p值。设定差异基因的筛选标准后,选取基因,可以进一步进行GO分析,KEGG 分析,网络分析。主要使用c...

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    把基因画在染色体上

    之前有一次,我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”,因此,我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后,最终用ggpl...

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    RNA-Seq:差异表达分析及可视化

    上一篇已经系统介绍了有参RNASeq上游分析,从测序数据fastq文件到最终生成表达矩阵。这一系列基本都是RNASeq通用常规分析,其下...

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    GSEA的分析汇总-转载

    GSEA的分析汇总 学习GSEA 生信技能树 GSEA的统计学原理试讲 GSEA GSEA这个java软件使用非常方便,只需要根据要求做好GCT...

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    生物小工具

    本文主要介绍一些生物小工具,尤其是在文章中的,还有就是生物信息学方面的,总而言之,言而总之,希望能够帮助到大家。 关键词:生物信息学工具;绘图工...

    11.1 天明豆豆 7 142
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    GO富集可视化:clusterProfiler+GOplot

    现在的社会正处于大数据时代,生物学研究领域也迎来了大组学时代。无论是植物。动物,还是微生物,都有许多物种被测序。在后续的个性化分析过程中,通常会...

专题公告

下游分析无底洞