单细胞高级分析36计 - 专题

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CellChat 三部曲3：具有不同细胞类型成分的多个数据集的细胞通讯比较分析
CellChat 三部曲3：具有不同细胞类型成分的多个数据集的细胞通讯比较分析加载所需的包[#load-the-required-librar...

0.9 Seurat_Satija 0 11
CellChat 三部曲2：使用CellChat 对多个数据集细胞通讯进行比较分析
CellChat 三部曲2：使用CellChat 对多个数据集细胞通讯进行比较分析加载所需的包[#load-the-required-libr...

3.5 Seurat_Satija 8 37

CellChat三部曲1：使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析
CellChat三部曲1：使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析自从周运来在简书写了一篇cellchat的中文介绍教程，然后R包作...

3.7 Seurat_Satija 5 53
NBIS系列单细胞转录组数据分析实战（一）：数据质控
Single cell RNA-seq analysis workshop 该系列课程由瑞典国家生物信息学基础设施(NBIS) 负责设置，为瑞典...

1.7 Davey1220 5 24
SCENIC转录因子分析实战---以Seurat的pbmc3K数据集为例
下面的代码复制粘贴即可运行，超级简单，如果是你自己的数据，你只需同样的模式做出来 exprMat 表达矩阵，和cellInfo的临床表型，就可以...

1.7 Seurat_Satija 1 21
单细胞108篇文献解读之10---Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat
大家好呀！今天为大家解读的是一篇于2021年1月17日发表于nature communications的文章，题目为Inference and ...

1.0 Seurat_Satija 0 9
cellchat整合多个数据集进行细胞通讯分析
Load the required libraries Create a directory to save figures Load Cell...

3.6 Seurat_Satija 0 24

SCENIC单细胞转录因子分析原理
1. 简介 SCENIC （single-cell regulatory network inference and clustering）是一...

0.7 Seurat_Satija 0 7
绘制scenic的转录因子调控网络图
其实我想画这张图，是scenic分析后转录因子的调控图。出自健明大佬分享的教程我记得小洁老师讲过ceRNA调控网络有类似的图。回去找了教程，...

1.2 Seurat_Satija 3 13
单细胞108篇文献解读之11---SCENIC: 单细胞RNA-seq数据推断基因调控网络和细胞功能聚类
目前单细胞转录组领域用的比较多的细胞聚类方法大多是直接从基因表达矩阵推断，但是对于多样本合并分析，很多情况下会出现难以解决的批次效应，例如：有些...

0.9 Seurat_Satija 0 15