还在利用hisat, tophat这些耳熟能详的软件将read比对到基因组(转录组)上,然后统计每个基因的count数么?试试这些不需要比对,速...
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差异分析流程示例与资料 基因芯片的差异表达分析主要有 构建基因表达矩阵、构建实验设计矩阵、构建对比模型(对比矩阵)、线性模型拟合、贝叶斯检验和生...
这个步骤推荐在R里面做,载入表达矩阵,然后设置好分组信息,统一用DEseq2进行差异分析,当然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。...
作业要求 需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件,并且用fastqc软件测试测序文件的质量!作业,理解测序...
linux基本命令 第六章 Linux文件与目录管理 极客学院服务器 高通量相关基础知识 生信一百讲 1、 Anaconda Anaconda是...
比对软件很多,首先大家去收集一下,因为我们是带大家入门,请统一用hisat2(官网https://ccb.jhu.edu/software/hi...