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收录了11篇文章 · 3人关注
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无root权限Linux下安装R 3.4.4及其依赖包等环境配置
最近课题用到的一个软件需要运行RScript，因此踏入了在Linux服务器上安装R的坑，一把辛酸泪，特此记录一下。 1. 下载并解压R 3.4....
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Aspera安装和配置Aspera是一项突破性传输协议，充分利用现有的 WAN 基础设施和通用硬件，传输速度比 FTP 和 HTTP 快达数百倍。 Aspera在Ub...
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利用SRA号从NCBI下载测序原始数据生物或医学中涉及高通量测序的论文，一般会将原始测序数据上传到公开的数据库，上传方式见测序文章数据上传找哪里；并在文章末尾标明数据存储位置和登录号...
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R语言入门与基础绘图系统 11. 什么是R语言？ R语言是一种自由软件编程语言与操作环境，主要用于统计分析、绘图和数据挖掘。 R语言是从S语言演变而来的。 2. R语言能干...
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从零开始学测序——转录组11. HGP时期低通量RNA序列研究方法 • Sanger测序 ▷Gene clone ▷Full-length mRNA ▷dbEST/Uni...
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如何从UCSC获取感兴趣区域的BED文件2019-02-12 1. 首先进入UCSC的Table Browser：https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgT...
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癌症基因组重测序分析五——体细胞拷贝数变异（CNV）与基因组结构变异（SV）鉴定 1. 什么是CNV？ Deletions and duplications of c...
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癌症基因组重测序分析三/四第三节主要内容：测序实验流程、测序原理及基本名词解释 1. 测序错误率原因：Phasing & Pre-phasing 2. 碱基质量评估方法：...
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癌症基因组重测序第二讲一、肝癌在临床遇到的问题 肝癌发生存在多中心起源假说，即多个癌灶之间在肝内是彼此独立形成的，那么这类病人可能尚属肝癌发生早期，通过手术切除能达到...
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