参考生信技能书一文打通单细胞上游：从软件部署到上游分析[https://mp.weixin.qq.com/s/pQyUieRVXohY1enqj...
投稿
收录了6篇文章 · 2人关注
-
NCBI公共数据库下载10x单细胞数据进行上游分析的全流程 -
GATK4 最佳实践-生殖细胞突变的检测与识别
欢迎关注"生信修炼手册"！ GATK4 对于体细胞突变和生殖细胞突变的检测分别给出了对应的pipeline: Germline SNPs+Ind...
-
从fastq数据到SNV | GATK
00 写在前面 仅针对人类WGS或WES数据，供参考。时间管理某一点：能自动化的工作尽量自动化，不要时间用在毫无意义的重复上。脑袋好比肌肉，需要...
-
WES 分析（从下载数据到IGV）1. 数据下载 SRP077971 选取其中三个wes下载 下载sra数据，每个耗时～25min sra转为fastq.gz(每个耗时～30mi...
-
WES/WGS，call变异流程学习。
WES/WGS，call变异流程学习。 第一步，QC 传统方法，FastQC 安装 FastQC的运行非常简单，直接在终端通过命令行是最有效直接...
-
全外显子测序（WES）分析流程
首先创建一个项目目录wes和存放每个步骤生成文件的子目录raw, clean, align, genome, hg19_VCF 此流程包含两个r...
专题公告
WES与WGS分析文章
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1976703/corr.png', '推荐专题《WES与WGS》（ 分享自 @简书 ）','http://39.103.169.235/c/6307bc479272?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','页面编码gb2312|utf-8默认gb2312'));){kind=link}