最近有很多人在给他们做完了WGCNA分析之后,跑过来问结果中各种图片的意思。我就整理一下WGCNA分析结果中常见图片的含义吧,如有理解错误,还请...
最近有很多人在给他们做完了WGCNA分析之后,跑过来问结果中各种图片的意思。我就整理一下WGCNA分析结果中常见图片的含义吧,如有理解错误,还请...
什么是WGCNA 1 样本聚类,查看是否有离群值 2. 找构建网络合适的阈值 左图纵轴:相关系数的平方,越高说明该网络越逼近无网络尺度的分布。右...
鉴于大量的转录组数据,可能出现的一个问题是“如果A组和B组都进行了转录组研究并报告了一些结果,这些结果的相容性如何?”目前基于转录组或芯片数据进...
1. 挑选软阈值 软阈值的要求:无尺度拓扑网络系数 R^2 高于 0.85,或者或平均连接度降到 100 以下 如果没有合适的阈值,可以使用 R...
文章来源:生信技能树原文:GEO数据挖掘-第三期-口腔鳞状细胞癌(OSCC)文章标题 A pplication of weighted gene...
文章来源:生信技能树原文:GEO数据挖掘-第四期-肝细胞癌(HCC) 疾病背景 肝细胞癌(HCC),起源于肝细胞,是全球第七大常见癌症。 每年全...
原文地址:https://mp.weixin.qq.com/s/p-4-WerJ6m2F9b5Ie-cerA WGCNA和差...
本篇代码参考文章:1.生信菜鸟团:一文学会WGCNA分析2.WGCNA(加权基因共表达网络分析)3.WGCNA分析,简单全面的最新教程4.WGC...
根据文章生信菜鸟团:一文学会WGCNA分析所讲: WGCNA输入数据的准备,主要有两个数据需要提前准备好:(1)是表达矩阵, 如果是芯片数据,常...
加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用来描述不同样品之间基因关...
专题公告
wgcna相关知识