1.数据准备 用10x数据做scVelo，输入数据分2部分: Seurat 分析后的数据: 聚类、基因、细胞信息。 velocyto run 输...
投稿
收录了15篇文章 · 23人关注
-
scVelo 的使用: 从bam和Seurat获取输入数据到画图
-
(Vim) 复合命令、重复、回撤
一键双雕——复合命令 很多Vim的单键命令都可以被看成两个或多个其他命令的组合。下面是类似的一些例子，它们有什么共同点呢？ 当我们输入ko命令时...
-
ATAC-seq基础知识（资源整理）ATAC-seq全名Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughpu...
-
samtools-faidx用法
faidx： samtools faidxxxx.fa 能够对fasta 序列建立一个后缀为.fai 的文件 该命令对输入的fasta序列有一定...
-
R数据可视化9:棒棒糖图 Lollipop Chart棒棒糖图，“望文生义”，就是长得像棒棒糖的图。听起来就很可爱是不是？今天就让我们一起欣赏一下棒棒糖图。 什么是棒棒糖图 首先让我们来看几张棒棒糖...
-
Dapars寻找APA1.下载ref：https://github.com/ZhengXia/dapars/releases 2.github主页：https://g...
-
celaref ||单细胞细胞类型定义工具Sarah Williams (2019). celaref: Single-cell RNAseq cell cluster labellin...
-
单细胞转录组学习笔记-16-用Scater包分析文章数据
刘小泽写于19.8.20-第三单元第九讲：使用Scater包笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术...
-
富集分析DAVID、Metascape、Enrichr、ClueGO前言 一般我们挑出一堆感兴趣的基因想临时看看它们的功能，需要做个富集分析。虽然公司买了最新版的数据库，如KEGG，但在集群跑下来嫌麻烦。这时网页...
-
生信学习基础_R语言06_Matching reordering匹配与排序
原文地址：https://hbctraining.github.io/Intro-to-R/lessons/06_matching_reorde...
专题公告
常用生信软件，包括通用的R语言、python等，以及专用的samtools、annovar等
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1800485/Jupyter-notebook.png', '推荐专题《生信分析软件》（ 分享自 @简书 ）','http://39.103.169.235/c/6e42ffb01087?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','页面编码gb2312|utf-8默认gb2312'));){kind=link}