1. 寻找软件所在的镜像 用conda安装软件的标准语法格式为： 其中-c这个参数很重要，通过它来指定软件下载的镜像位置 对于我们这些生物信息学...
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conda软件安装的进阶操作 -
第9章 单通道实验设计
9.1 背景介绍 与早期的微阵列不同，大多数数据现在都是单通道类型。单通道数据来自流行的微阵列技术，如Affymetrix，Illumina或A...
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conda 创建/删除/重命名 环境
创建新环境 删除环境 重命名环境 conda 其实没有重命名指令，实现重命名是通过 clone 完成的，分两步： 先 clone 一份 new ...
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整合QC质控结果的利器——MultiQC一、MultiQC介绍 NGS技术的进步催生了新的实验设计、分析类型和极高通量测序数据的生成。对于这些数据的质量评估，每一步分析结果的评估是后续...
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高通量测序质控及可视化工具包RSeQC本期介绍一个测序质控的工具包:RSeQC包,它提供了一系列有用的小工具能够评估高通量测序尤其是RNA-seq数据.比如一些基本模块;检查序列质量...
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clusterProfiler使用心得(1)
date: 2017.10.18author: Jinwen 前言 大家都在诟病DAVID而推荐R包clusterProfiler，所以我也跟风...
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clusterProfiler: 分析+可视化GO和KEGG富集的转录组R包写作之友 基因和基因簇的功能谱 (functional profiles) 的统计学分析及可视化 G Yu, LG Wang, Y Han, Q...
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无生物学重复RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expression data without biol...无生物学重复RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expr...
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RNA-Seq差异表达分析-扩展综述及新工具RNA-Seq差异表达分析-扩展综述及新工具 理解不同生物在不同条件下表型差异的关键是确定不同条件下差异表达基因(DEGs)。转录组的高通量测序...
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常用生物信息学格式介绍(fasta、fastq、gff2、gtf(gff2.5)、gff3、bed、sam、bam、vcf)前言 在各个行业都是有行业标准的，这样才能统一规范而方便后面的分析，在生物信息学领域中主要是各种大量序列数据、注释数据等，这些都是有特定的格式去...
专题公告
RNA-seq 个人学习专用
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