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收录了28篇文章 · 18人关注
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ROC曲线——相关文献实例、原理和绘制方法前言 最近接触到ROC曲线相关的问题，因此下面整理出相关的文章，记录相关原理和应用。 数据分析最让人着迷的一种用途是可以基于现有数据创建能够区分...
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miRNA分析--数据过滤（一）MicroRNA (miRNA) 是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小 RNA，其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个 miRNA 可...
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ＴＣＧＡ和GＴＥｘ的数据联合分析实战0.缘起 很多文章中用到GEPIA这个网页工具来进行TCGA和GTEx表达量的联合比较，但在此之前我不知道要怎样在R语言中实现。这个GEPIA...
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TCGA-12.支持向量机生存模型
花花花写于2020-02-07 闭门不出的第n天，我们将原定于下周一的学习小组提前到今天开始了，我也收到公司通知，我们可能五一之前都没办法出去做...
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TCGA甲基化数据下载以及相关临床信息整理之前的文章里已经按照教程进行了TCGA数据库的一些练习（RNA-seq、芯片、生存分析），现在学习TCGA甲基化数据的分析过程。 参考文章：1....
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Docker封装生物信息学甲基化流程
CpG CHG CHH含义p代表磷酸二酯键，CpG指的是甲基化的C的下游是1个G碱基。H代表除了G碱基之外的其他碱基，即A, C, T中的任意...
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利用R包TCGAbiolinks进行各种数据下载下载TCGA数据的方法有很多，上一篇介绍了如何用gdc-client批量下载数据，基于网上有很多用TCGAbiolinks包下载数据的教程，所以...
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用随机森林算法进一步筛选差异表达基因前言 很多时候，我们分析完差异表达基因后，发现会得到一大堆差异基因，常见的做法有降低Pvalue的阈值，挑选fold-change最大的基因，做...
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TCGA学习04：建模预测-lasso回归TCGA学习01：数据下载与整理 - 简书 TCGA学习02：差异分析 - 简书 TCGA学习03：生存分析 - 简书 TCGA学习04：...
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