这个是有机结合生物信息学的linux和数据格式的练习题:下载bowtie2软件后拿到示例数据: 1)统计reads_1.fq 文件中共有多少条序...
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首先使用bowtie2软件自带的测试数据生成sam/bam文件,代码如下: LINUX练习题 统计共多少条reads(pair-end read...
首先使用bowtie2软件自带的测试数据生成sam/bam文件,还有vcf文件代码如下: LINUX练习题 把突变记录的vcf文件区分成 IND...
一、在任意文件夹下面创建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夹系列。 二、在创建好的文件夹下面,比如我的是 /Users/jim...
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1. 为什么要学习使用Linux系统? 官方解释:Linux优点:1.批量;2.高效;3.多用户实际解释:90%生物信息学软件均在Linux上运...
从修剪前后的fastq文件中各取100000行,将fastq格式文件每个序列的4行合并为1行,分别保存为raw.txt和filter.txt 从...
bowtie2 bcftools
首先友情宣传生信技能树 全国巡讲:R基础,Linux基础和RNA-seq实战演练 : 预告:12月28-30长沙站 广州珠江新城GEO数据挖掘滚...
【生信技能树】fasta和fastq格式文件的shell小练习这个是有机结合生物信息学的linux和数据格式的练习题:下载bowtie2软件后拿...
专题公告
欢迎大家分享自己在完成生信技能树linux作业时的笔记心得 。
生信人的 linux 20题 <http://www.bio-info-trainee.com/2900.html
处理 fastq,fasta,sam,bam,vcf,gff,gtf,bed,MAF等**格式(约定成俗,大牛推广)**的数据
fasta和fastq格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3575.html
sam和bam格式文件的shell小练习 http:...