最近有一批转录组数据，其实不是时间序列的数据，而是从低到高有4个梯度的Al浓度处理的数据，每个三个重复，共有12个数据，想着看一下4个梯度处理下...
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STEM软件分析基因表达模式 -
R - 相关性分析相关性分析用于评估两个或多个变量之间的关联性。 1. 两个变量的相关性分析 参数相关性检验( parametric correlation ) ...
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R语言subset()函数取子集无法改变因子水平数
R语言中使用subset()和while取子集，你会发现子集的因子水平数没有改变。那么问题来了，对子集用table()怎么才能去掉未使用的因子？...
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「r<-包|ggplot2|grid」ggplotify——连接各类R图形在作图的时候想拼接不同的图形对象，如pheatmap 包的热图、ggplot2 对象以及 base 图形等。 这里找到了Y叔的ggplotify...
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转录组分析——如何寻找差异基因中的中枢基因（hubgene）一、前言 好久没更新过文章啦，今天我们来聊一聊怎么找hubgene。 二、常见的寻找hubgene方法 我们如果要研究一个疾病，通常会做一个疾病...
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ggplot2高效实用指南写在前面 ggplot2 是一个功能强大且灵活的R包 ，由Hadley Wickham 编写，其用于生成优雅的图形。ggplot2中的gg 表...
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clusterProfiler: 分析+可视化GO和KEGG富集的转录组R包写作之友 基因和基因簇的功能谱 (functional profiles) 的统计学分析及可视化 G Yu, LG Wang, Y Han, Q...
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Bioconductor没想象的那么简单(part3)刘小泽写于19.4.2主要看看IRanges的基本用法 上次写了关于RangeData的介绍：https://www.jianshu.com/p...
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R绘制韦恩图
目前做Venn图的R包中，VennDiagram是常用的包，可以做2元到5元的图。下面介绍一下2元到5元venn图的做法。 1 安装包 2 数据...
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浅探富集分析中的超几何分布当我们从测序数据中得到了一系列的基因后，我们需要研究这些基因都属于那些通路，那些通路是跟我们研究课题相关的。为了解决这一问题，最常用的做法就是做...
专题公告
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