简单说明： 从2.28.0版开始，bedtools使用htslib库支持CRAM格式 除了BAM文件，bedtools默认所有的输入文件都以TA...
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Bedtools genomecov 计算覆盖度 -
除了GO基因本体论，还有PO、TO、CO等各种Ontology？我们最常用最熟悉的功能数据库之一：GO（gene onotology），基因本体论。其实是一套标准词汇术语，目的是从不同角度来描述某个基因的特点...
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把基因画在染色体上之前有一次，我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”，因此，我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后，最终用ggpl...
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CNV拷贝数变异分析（GISTIC、maftools）CNV拷贝数变异分析是什么？贴一段TCGA官网的介绍 "The copy number variation (CNV) pipeline use...
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2019-11-08 记录CNV数据分析学习（四）昨天在复习Linux基础知识，没有继续记录，今天继续参考学习资料TCGA CNV全攻略 具体数据处理流程见NIH的TCGA官网：https://...
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GTF与GFF一、格式介绍 （一）gtf 文件。GTF 为General Transfer Format缩写，跟 GFF2格式类似。相信大家做转录组分析时候经...
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CNV calling | DELLY基于paired-end mapping methods 和 split-read analysis，检测结构变异。 写在前面 Delly is...
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使用Plink对CNV做GWAS分析（一）
Introduction 随着高通量测序技术的发展，这些年关于CNV（拷贝数变异）的研究也逐渐多了起来。以往CNV主要通过PCR或者CGH芯片等...
专题公告
相关分析的软件安装，方法，
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