1 CD45.1和CD45.2 1.1概述： CD45是存在于除红细胞和浆细胞之外的造血谱系的所有细胞中的受体连接的蛋白酪氨酸磷酸酶。CD45在...
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2022-11-14 几个常见免疫学文献中成对概念
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利用TRUST4从bulk RNA-seq中重构免疫组数据
昨天老师发给我一篇生信女神Shirley Liu的文章，看了里面的内容之后感觉很兴奋～它可以不做免疫组测序，直接从Bulk RNA-seq或者s...
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免疫组库多样性（Richness/Diversity/Clonality）的计算Calculation of repertoire metrics VDJTOOLS的CalcDiversityStats函数提供了直接计算功能...
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免疫组库分析实战/mixcr+vdjtools+R实现使用《OncoImmunology》一篇paper中的数据进行实战 数据获取地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bi...
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使用vdjtools进行免疫组库分析mixcr与vdjtools是基于java平台开发的处理从原始序列到定量克隆型的大量免疫组数据的免疫分析软件，在使用前要确保java环境是ok的...
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使用mixcr构建免疫组库及下游分析免疫组库（Immune Repertoire，IR）是指个体在某个特定时间其循环系统中所有多样性的T细胞和B细胞的总和，即V(D)J序列多样性的...
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单细胞研究联合T细胞受体分析2022年【最新进展】这篇文章是单细胞转录组（scRNAseq）和TCRseq联合分析的一个综述，介绍了目前关于这两种数据联合分析的最新进展(2022年)。 1. 介...
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单细胞免疫组库VDJ——CellRanger结果解读（三）一、outs目录概括 以下是10X官方给出的一个典型的vdj运行后的output 目录： 二、web_summary.html 文件web_su...
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单细胞免疫组库VDJ——CellRanger（二）10× Genomics提供了完整的数据分析方案，单细胞数据转录组分析类似，VDJ数据也使用CellRanger软件进行分析，在使用之前，我们先...
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