生物信息学与基因组学 - 专题

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读李霞老师《生物信息学》教材
第一次知道李霞老师是在2019年“数学、计算机与生命科学交叉科学青年学者论坛”上，详见：2019||数学、计算机与生命科学交叉科学青年学者论坛。...

0.4 周运来就是我 0 7
经典：基因组测序数据从头拼接或组装算法的原理
原作者：https://www.cnblogs.com/aipufu/p/11596253.html https://www.cnblogs.c...

4.4 无理取now 1 30

生成特定碱基比例的随机序列
#!/usr/bin/perl use strict; use warnings; use BioX::SeqUtils::RandomS...

0.2 dulunar 0 2
【现学现卖·自学生信】链霉菌的全基因组分析（1）
Complete genome sequences ofStreptomyces spp. isolated from disease supp...

3.3 番茄随笔 0 5
回顾 | 系统进化树构建的常见方法
构建进化树的方法主要分为距离矩阵法（含 UPGMA、ME、NJ等）最大简约法（MP）极大似然法（ML）贝叶斯法（Bayesian）基于...

1.6 生信石头 0 7
「来绘图吧！」链特异性测序的read depth绘制
以酿酒酵母为例，用到的数据如下，随便找一个链特异性测序的fastq用常见比对软件跑一下都行。有一些数据我放在github，可参考：https:/...

0.7 陈有朴 2 6
你真的搞懂测序技术了吗——第二代测序
本文首发于“生信大碗”公众号，转载请注明出处之前我们讲了测序以及第一代测序技术，还没看的小伙伴可以先去补补课（你真的搞懂测序技术了吗——测序、...

1.3 生信大碗 2 12

机器学习入门总结和各类常用神经网络汇总(第一篇)
这里总结了李宏毅老师的机器学习的课程。首先我们将会了解到机器学习的概念，但是课程的主要观点将会聚焦到Deep Learning。进行了解之后我们...

5.2 小黄不头秃 0 24
表达质粒构建之引物设计
比如我现在需要表达FUS这个蛋白，首先我要确定FUS的CDS区序列，使用NCBI即可获得；可以看出FUS有三个同源异构体，我们以第一个X1为例...

1.3 找兔子的小萝卜 5 7
计算分子进化-搞懂PAML的正选择分析
许多基因组的文章里都会提到使用PAML进行基因的正选择分析(positive selection), 网上也有一些教程介绍如何用PAML进行分析...

4.5 xuzhougeng 2 46