本次推送是文献分享22的对应内容。我与生信，公众号：我与生信文献分享22：泛基因组解析柑橘亚科进化以及柑橘果实中柠檬酸积累的关键基因[http:...
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生信分析22：完整的转座子注释流程 -
小鬼的sRNA分析笔记（一）|| tsRNA分类分析：seqac包标题：tsRNA分类分析：seqac包 tRNA的二级结构如下： 根据其二级结构，tsRNA分类如下： 早期研究报道，tiRNAs通过血管生成素...
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跟着NC做基因组数据分析本期内容为[跟着NC做基因组数据分析]，这是你需要的教程，对你一定有帮助。 前言今天花费找文章，看到一篇关于基因组，组装的文章，主要是里面的图吸...
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【基因组学】使用StringTie+gffread鉴定基因的新转录本写在前面 转录组通常被用来寻找差异基因，但是有的时候我们想看一下已报道的基因是否存在可变剪切现象，即新转录本的挖掘，这个时候就需要利用S...
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RNAseq比对流程pipeline脚本自己在参考大牛的基础上，总结了RNAseq比对流程pipeline脚本。在做好前期准备工作后，可以一步完成从fastq到表达矩阵的所有步骤，目前...
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转录组数据分析之时序分析（maSigPro包）在转录组数据分析过程中，我们最常做的是不同处理方式的样本之间的比较（Treated vs Control），这时候我们采用“DEG分析+path...
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tximport 将 Salmon 定量结果导入 DESeq2
在《Salmon 进行转录本定量》[https://www.jianshu.com/p/f62fd85113d3]文章介绍了 Salmon 定量...
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使用edgeR进行无重复差异表达分析写这篇文章一部分原因是填2年前的一个坑 转录组入门（7）：差异表达分析. 另一部分原因是GQ最近又在搞一波无重复的差异表达分析, 所以专门去学...
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Gfold说明书（备份）
本文资料来源 https://web.archive.org/web/20161125133249/http://compbio.tongji....
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RNA-seq完整分析过程linux基本命令 第六章 Linux文件与目录管理 极客学院服务器 高通量相关基础知识 生信一百讲 1、 Anaconda Anaconda是...
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