拿到NGS全基因组下机序列以后肯定是Fastqc+Cutadapt+Trimmomatic去引物序列，匹配序列对原数据进行一波操作猛如虎的过滤。...
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2022你还在用fastqc？超高速fastq前处理工具教程 -
ChIP-seq数据质控与过滤刘小泽写于2020.4.15首先是ChIP-seq分析的前言介绍部分：1：了解ChIP-seq的实验流程2：继续了解ChIP-seq3：关于Ch...
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Trim Galore ——自动检测adapter的质控软件之前分析过的测序数据，数据质量都很好，给了我一个错觉质控的前后差别不是很大，内心里对质控这一步也就不是很重视，跑完质控有时也懒得看结果，拿到一批...
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RNA-seq分析（STAR-RSEM-DESeq2）
一、准备RNA-seq数据 需要参考基因组文件，注释文件，样本的fastq.gz文件 检查fastq.gz是否完整 二、fastqc生成质量报告...
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2020-01-23 RSEM转录组RNA-seq测序分析实操测序数据的质控和过滤 见上一篇论文 https://www.jianshu.com/p/0a8461b1ea7a[https://www.jia...
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#LncRNA从入门到精通#LncRNA从入门到精通[https://mp.weixin.qq.com/mp/appmsgalbum?__biz=MzAxMDkxODM1...
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【原创】hisat2-samtools-htseq转录组分析记录2018-10-08-09-11 hisat2-samtools-htseqhisat2 -t -x ~/rna_seq_analysis/reference/index/hg19/genome -1 ~/rna_seq...
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RNA-seq数据的上游处理及工具HISAT2; STAR; RSEM; featureCounts; Htseq-count; kallisto; salmon
欢迎批评指正 一、上游处理流程 上游处理步骤包括质量检测、质量控制、比对、定量[2]，每一步处理数据的目的都是不同，也有相关的软件与之对应。通过...
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「文献06」植入前胚胎的染色质可及性和转录组图谱日期：2019年2月9日——2019-Week6分类：「思路,方法」题目：An integrated chromatin accessibili...
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Week25 — 人类原发性肿瘤的染色质可及性图谱-02Week24 — 人类原发性肿瘤的染色质可及性图谱-01上篇文章首先回顾了ATAC-seq方法的原理和优点，以及与其他研究染色质可及性方法的比较...
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