findOverlaps findOverlaps - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/6...
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找peaks的重叠
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shell玩转各个不同的gtf和gff文件--ID转换杂谈玩转gtf 查看gtf每一行的信息 发现第九行是基因ID 第九行后用';'分隔后的第一行是gene_idimage.png 下载refseq g...
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根据GTF画基因的多个转录本结构
外显子和内含子是转录本上面的概念，是基于转录这个行为的定义。 而5端UTR区域和CDS区域，还有3端UTR区域,是基于翻译这种行为的定义！ UT...
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转录因子详细介绍(motif)TF: transcription factor转录因子TFBS: transcription factor binding site转录因子结...
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motif分析——从实战到原理（Homer篇）一、不求甚解系列 软件下载及配置 conda安装： conda install -c bioconda homer 使用configureHom...
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生信 | ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到...
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deeptools？还可以这么用！说到deeptools，[https://www.baidu.com/link?url=6F9PeldteljlCkBMSOkg1_W9oDlm...
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生信软件 | bowtie2（测序序列与参考序列比对）
1. 介绍 Bowtie2 是将测序reads与长参考序列比对工具 (适用于将长度大约为50到100或1000字符的reads与相对较长的基因组...
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trim-galore并行处理时对文件的处理顺序
具体流程见trim_galore去接头(并行处理)命令为 config是需要进行处理的文件列表trim_galore命令这里用的也比较简单，总结...
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怎么区分生物学重复与技术重复很长一段时间里发现一个问题，在平常的实验过程中，有一些童鞋还是会对生物学重复和技术重复有一些混淆，今天我们彻底再重温一下。 1、怎么区分生物学重...
专题公告
分析
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