前面RNA-seq分析:从软件安装到富集分析部分已经把转录组全部流程走完了一遍,这次利用RNA-seq(2)-2:下载数据中下载的肝癌数据进行分...

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RNA-seq分析简洁版[https://www.jianshu.com/p/72c871663e62],用重新下载的肝癌数据[https://...
最近读到一篇博文,介绍了学习 RNAseq 数据分析非常推荐的两篇综述和七个在线教程并发表了相关评论。本文将进行简要整理并对相关评论内容进行大致...
superqun原创 一、流程概括 RNA-seq的原始数据(raw data)的质量评估 linux环境和R语言环境 raw data的过滤和...
知识的学习没有一蹴而就,没有捷近,扎实的学习是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的综述,全面而详细!深度好文,可用来反复阅读。初学者用于把...
前言 这次给大家带来的是16年发表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇处理RNA-seq数据的文章:Transcript-level e...
参考基因组下载有三大全文网站提供参考基因组下载,它们分别是:1.NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/grc)2...
DEseq2筛选差异表达基因并注释(bioMart) DESeq2对于输入数据的要求1.DEseq2要求输入数据是由整数组成的矩阵。2.DESe...
原始数据来源于这篇文章https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE50177 1...
转录组入门(4):了解参考基因组及基因注释在UCSC下载hg19参考基因组,我博客有详细说明,从gencode数据库下载基因注释文件,并且用IG...