将原始fq文件通过FastQC-align-samtools||GATK等流程最终得到vcf文件，也就是记录某些位点变异的文本文件。但只是通过看...
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用annovar对vcf（SNP&INDEL）文件进行注释
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WGD（全基因组复制）分析——Ka/Ks及4Dtv值计算一、4Dtv（四倍简并位点颠换率）的定义 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative)...
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基因组测序数据的处理和分析流程
第一步，测序数据的质量检查。测序的原始数据的标准文件为fastq格式，是原始图像数据文件碱基识别转化得来，通常称为 raw reads。fast...
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把基因画在染色体上之前有一次，我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”，因此，我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后，最终用ggpl...
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MCScanX使用小记一篇不知道拖了多久的笔记……欠下的债早晚还是要还的…… 0.软件下载及安装 官网： http://chibba.pgml.uga.edu/mcs...
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「生信」共线性分析——MCScanX目录MCScanX下载及安装数据准备MCScanX运行及结果Ka & Ks 计算下游画图脚本最后 MCScanX有两个主要的功能, 一是, 方便...
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TBtools物种间共线性分析使用教程首先非常感谢CJ老师开发的TBtools工具，给生信分析带来了极大的便利，详细内容介绍请参考https://www.jianshu.com/p/...
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零基础多物种间共线性分析首先非常感谢Cj大神开发出来的TBtools生信工具，为生信分析做图带来了极大的便利。作为生信小白，在做多物种间共线性分析时，尝试了多种方法，苦...
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