Glmnet主要用于拟合广义线性模型。筛选可以使loss达到最小的正则化参数lambda。该算法非常快,并且可以使用稀疏矩阵作为输入。主要有线性...
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简介例1. 不同品种代谢产物OPLS-DA loading plot1 安装2 内置数据介绍 代谢物对个体性别的定性响应 - PLS执行PLS-...
MetaboAnalyst是做代谢的R包,功能十分强大。也开发了web版本,代谢组学的分析这里不介绍,主要讲讲它开发的多组学分析的相关内容。 既...
@文章翻译自SERRF主页 SERRF是什么 SERRF的全名叫Systematical Error Removal using Random ...
导读 通路富集分析技术对于理解代谢组学数据背后的潜在生物学意义是非常有用的,它们的目的是根据代谢途径中所包含的先验知识,为受影响的代谢物提供上下...
最近手里有个非靶向代谢组的数据,通过学习MetaboDiff包来熟悉代谢组分析的思路和流程,接下来的流程来自于MetaboDiff包官方帮助文档...
导读 质量控制是基于质谱组学数据获得可重复性和准确性结果的必要步骤。重复使用相同的QC样本在MS run order序列中对信号漂移的评估和校正...
各个软件列表和优缺点如下: 1、XCMS XCMS是2006年发布的、基于R语言的用于LC-MS数据处理分析的软件[2]。该软件是命令行驱动的,...
@我的博客:有味 导读 写这篇文档的初衷就是一直想把代谢组学数据写成一个小流程,之前关于非靶向代谢组学写了一个分析总结——非靶向 | 靶向代谢组...
主要内容: 1. 原始数据预处理概述; 2. 主要分析软件汇总; 3. 数据预处理的方法。 1. 原始数据预处理概述 1.1数据预处理及其目的 ...