NCBI&Ensembl&UCSC&EBI&Genecode - 专题

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提取基因长度genelength
# 下载gtf：选择的是ensembl的GRCh38.94.gtf：下载地址：ftp://ftp.ensembl.org/pub/releas...

0.8 苏牧传媒 5 9
挖掘PubMed数据库，获取报道的或推测新的基因调控关系
生信宝典之傻瓜式推出过基于Cytoscape的插件literature search进行文献挖掘查找指定基因调控网络的方。近来发现一款神奇的在...

0.4 生信宝典 0 6

本地安装UCSC基因组浏览器
UCSC基因组浏览器在大规模高通量数据的可视化和比较分析研究中发挥着重要的作用。拥有了本地浏览器，就可以对自己的测序数据进行更深入的分析和共享使...

0.4 生信宝典 3 6
用UCSC Xena看癌症基因的表达量及生存量
UCSC Xena允许用户探索基因组和/或表型变量之间相关性的功能基因组数据集。其囊括TCGA等多个数据库的数据。我们以BRCA的C21orf5...

0.5 Forest_Lee 0 5
UCSC基本使用技巧-找数据
找到感兴趣的基因组打开UCSC，把鼠标置于导航条的 “Genomes”; 从左边的进化树中找到感兴趣的并点击，或者从genome下拉菜单中选中...

0.6 zhoujj2013 1 7
在UCSC browser上查看ENCODE项目中的ChIP-seq数据以及FANTOM项目中的转录数据
可以用来分析上游可能结合的通路，具体打开方法如下： 1.打开http://genome.ucsc.edu/ENCODE/ 2.选View ENC...

0.2 547可是贼帅的547 0 3
UCSC基因组浏览器系列
最早的基因组浏览器，主要是为人类基因组设计的。Kent是基因组浏览器的设计者，有兴趣可以浏览：https://users.soe.ucsc.ed...

0.3 zhoujj2013 0 1

UCSC ENSEMBL NCBI基因组各个版本对应关系下载地址
一、对应关系 NCBI的版本包括GRCh36,37,38，UCSC包括hg18,19,38, ENSEMBL有各种release，他们之间的对应...

0.2 高邮在逃咸鸭蛋 7
从NCBI-SRA和EBI-ENA数据库下载数据
NCBI-SRA和EBI-ENA数据库 SRA数据库: Sequence Read Archive：隶属NCBI (National Cente...

5.2 dulunar 6 74
NCBI数据库与工具
文献类： PubMed ：Biomedical literature citations and abstracts生物医学文献引文和摘要 Pu...

0.1 quan575 7 2