MEGAN(Metagenome Analyzer)是宏基因组学进行物种和功能研究的常用软件,实际上现在的Diamond+MEGAN6已经是一套...
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宏基因组学 宏基因组学[https://baike.baidu.com/item/%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%BB%84%E5%...
昨天下午捣鼓了一下宏基因组物种注释过程(基于nr库),现在将整个流程记录一下。软件需求:blast,diamond,taxonkit(安装自行百...
导读 使用 HUMAnN2(The HMP Unified Metabolic Analysis Network 2)进行宏基因组学分析。 HU...
Contigs/Scaffolds序列经基因预测、ORF开放阅读框识别(Open Reading fr ame)和蛋白翻译之后,就可以进行功能注...
1. 简介 Kraken2是一个基于k-mer算法的高精度宏基因组序列分类软件,能够快速的将测序reads进行物种分类。 Kraken2官网[h...
导读 HUMAnN(全称HMP Unified Metabolic Analysis Network)最早由Curtis Huttenhower...
导读 上一篇介绍了MetaPhlAn:宏基因组微生物分类分析教程[https://www.jianshu.com/p/015cbdb80ce1]...
导读 1 MetaPhlAn获得宏基因组物种和物种丰度2 MetaPhlAn结果合并和可视化3 GraPhlAn绘制进化树4 LEfSe寻找分类...
宏基因组学(metagenomics)是一种以环境样品中的微生物群体所有基因组作为研究对象,利用基因组学的研究策略研究环境样品中所包含的全部微生...
专题公告
宏基因组