上周为了督促自己有效的学习，立下了每周至少更一篇生信学习笔记的flag。 本打算从这周开始先写一系列的生信基础概念知识，没想到很快就接到了大佬J...

一、背景介绍 通常，BED文件的overlap/intersect的操作，可以BEDtools intersect功能完成overlap和统计：...

趁着零碎的时间整理了下ChromHMM的相关内容。 ChromHMM是基于ChIP-seq组蛋白数据检测染色质状态的工具。 基因组区域特定的组蛋...

所谓：操千曲而后晓声，观千剑而后识器。 作为一个开源软件，R的一个非常大的优点就是我们可以随意查看所有算法的源代码，在对这些源代码进行分析的过程...

巨噬细胞吞噬实验作图：

上篇文章中提了一下如何通过ggpubr包为ggplot图添加p-value以及显著性标记,本文将详细介绍。利用数据集ToothGrowth进行演...

接下来会花时间认真学习和理解热图，这篇文章以后会成为导航，有兴趣的朋友可以收藏下。 Author: Zuguang Gu ( z.gu@dkfz...

这是ggplot2可视化专题的第二个实例操作 【ggplot2的基本思路见前文总论】：基于ggplot2的RNA-seq转录组可视化：总述和分文...

一般提到富集分析，首先想到的就是GO、KEGG这两把刷子，然后还需要知道两个重要概念：前景基因、背景基因 前景基因：你关注的要重点研究的基因集；...

1. 背景介绍 关于绘制临床研究报告中亚组分析的森林图，我过去几乎试过了所有可能的工具，最早用绘制meta分析森林图的方法绘制临床研究亚组分析森...