Science 发表了题为“Dual domestications and origin of traits in grapevine evol...
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2023《Science》 葡萄的双重起源 -
Matrix eQTL分析目前针对QTL分析有很多软件，比如Plink、 Merlin、R/qtl、FastMap等等,今天给大家分享一下如何使用Matrix eQTL进...
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MatrixEQTL-----eQTL分析
好久没有发简书了，去学习新技术新知识去了，实在是没有时间！！现在有点时间，记录分享一下新知识~这段时间也是被这个eQTL搞得很头疼，现在终于弄出...
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fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic history)1. 群体演化历史分析的案例： 群体演化包括有效群体大小(Ne)变化、基因流，迁徙，分化等，会对等位基因频率产生显著影响，塑造了现有遗传多样性的...
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基于Vcf文件进行基因单倍型分析单倍型，是单倍体[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%E4%BD%93/304058...
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ROH、近交系数、亲缘系数、IBD、IBS连续纯合片段（runs of homozygosity, ROH）是亲代将同源相同的单倍型传递给子代而形成的，基于ROH计算的基因组近交系数是个...
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2021-01-04根据SNP验证自然选择—XPEHH分析转载自https://mp.weixin.qq.com/s/1IM6KSCGIq0cUJhKKXVcIw 背景 选择清除分析是常用于鉴定群体基因...
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haploPS、XP-EHH、 Fst检测正向选择信号的实例介绍
欢迎来到"bio生物信息"的世界 下面是一篇文献介绍。 关于人类基因组正向选择信号的检测分析。 1.正向选择的概念 正向选择：某一突变位点逐渐积...
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生信学习笔记：使用SNP data做基因渗入分析 (3)
距离上次更新这个专题后，该教程的原作者更新了一下原教程，使用了一个新的，非常好用的工具，Dsuite进行基因渗入分析，这期的推文就和大家一起回顾...
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rehh：单倍体/单倍型群体间选择信号分析（基于selective sweep）本文介绍的方法都是基于Extended Haplotype Homozygosity (EHH)概念，由SABETI 等人在 2002年提出。简...
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