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RNA-seq如今已经成了最受宠爱的生信分析了,而如今琳琅满目的各种生信软件摆在具有新时代选择困难症的同学们眼前我们又犯难了。我们该选择哪套流程...
CDS是编码一段蛋白产物的序列。 外显子(expressed region)是真核生物的一部分,它在剪接(Splicing)后仍会被保存下来,并...
单核苷酸多态性(SNP)是基因组DNA序列变异的主要形式。但大多数的snp并不影响蛋白质序列,这些SNP主要通过对基因表达调控来影响生物个体。研...
模式生物做什么都简单,非模式生物则很多缺少注释,没有注释你就没法做,只能是借助于各种软件比如blastgo,自己跑电子注释。但今天要讲的不是这种...
将原始fq文件通过FastQC-align-samtools||GATK等流程最终得到vcf文件,也就是记录某些位点变异的文本文件。但只是通过看...
首先制作bed格式的文件包含基因组全部的外显子区域坐标如下: 从vcf文件中提取位于exon区域的变异位点
参考:http://www.genek.tv/article/27
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