9篇文章 · 3934字 · 13人关注
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使用jcvi绘制微共线性(Microsynteny)这篇文章更多是记录性质的，因为没有详细说明如何从WGDI, MCScan, MCscanX中获取基因对，也没介绍如何整理出记录基因坐标的bed文...
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使用jcvi基于wgdi的共线性结果(-icl)绘制点图
在如何用WGDI进行共线性分析(上)[https://www.jianshu.com/p/a50548e81ac0], 我们基于blastp的结...
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如何安装JCVI
使用conda安装 使用时需要启动环境 在此基础上可以更新到最新版的JCVI (Github版本会不断的增加新功能并修订bug） 安装额外的依赖...
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「JCVI教程」如何绘制CNS级别的共线性图（上）本教程借鉴https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version). 我们...
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「JCVI教程」JCVI的模块简介JCVI的使用基本格式为python -m jcvi.模块.子功能 实际操作，因此了解JCVI的模块能够帮助我们去找到需要的功能。根据JCVI的...
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「JCVI教程」如何在Linux下安装JCVI
JCVI是利用Python编写的，能用于基因组组装、注释和比较基因组学分析。之前写过几篇介绍它的使用，这篇单独介绍它的安装。此外，虽然JCVI最...
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「JCVI教程」如何绘制CNS级别的共线性图（中）在「JCVI教程」编码序列或蛋白序列运行共线性分析流程（上）还是有一个尴尬的事情，就是只用到两个物种，不能展示出JCVI画图的方便之处，因此这里...
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「JCVI教程」如何基于物种的CDS的blast结果绘制点图(dotplot)这是唐海宝老师GitHub上的JCVI工具的非官方说明书。该工具集的功能非常多，但是教程资料目前看起来并不多，因此为了能让更多人用上那么好用的工...
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jcvi.apps里的fetch模块使用介绍
这是唐海宝老师GitHub上的JCVI工具的非官方说明书。该工具集的功能非常多，但是教程资料目前看起来并不多，因此为了能让更多人用上那么好用的工...
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