
根据测序数据的类型和样本的群体可以分为如下的类型: 方法分析软件优点缺点适用场景统计Phasing(SHAPEIT4, Eagle2)无需额外实...
染色体的不同单倍型组装(即对个体中父源和母源两套染色体组分别进行精准组装)是基因组学研究的重要突破,其意义体现在多个领域,从基础遗传机制解析到临...
smc++又称为smcpp,从官方github下载文件https://github.com/popgenmethods/smcpp[https:...
获取到群体的二代重测序数据后,分析的步骤和思路。此处只讲大的思路和步骤,不讲具体的每一步的命令,网上搜索对应的软件会有一堆教程。 使用bwa比对...
pixy用于从vcf变异文件中计算pi(π),Dxy和Fst的值。 1.使用conda安装pixy github[https://github....
必读文献清单:1.2017年综述 《全基因组测序方法:优点,局限性和实用建议 》https://onlinelibrary.wiley.com/...
69种工具检测SV对比 https://www.jianshu.com/p/85ff211b4b4e[https://www.jianshu....
annovar和SnpEFF内置不利变异分析工具。输出文件详细说明 https://brb.nci.nih.gov/seqtools/colex...
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