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CytoTRACE2-basicCytoTRACE2 CytoTRACE2是 Newman Lab[https://anlab.stanford.edu/] 开发的用于预测sc...
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R-Seurat V5 to H5AD
最近想将单细胞数据从Seurat转换到H5AD格式，但发现Seurat V5直接转换会报错。这里记录一下解决的方案。 直接转换会报错 Error...
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Geneformer | 基因分类预测Gene Classification 上一篇文章写了用Geneformer如何做细胞分类[https://thereallda.github....
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Geneformer | 细胞注释Geneformer 是一个基于30M scRNA-seq data训练的Transformer模型，训练数据包括人类的多种组织器官。Genef...
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scanpy | 基本单细胞数据分析流程scanpy | Preprocessing and clustering 3k PBMCs 本文记录使用scanpy处理3k PBMCs sc...
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R-SCENIC 单细胞转录因子调控网络分析文章接受，终于有空再发点笔记了😃 SCENIC_Tutorial[#scenic_tutorial]Setup[#setup]Load Pack...
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R-Seurat单细胞数据分析流程Seurat standard pipeline[#seurat-standard-pipeline]创建Seurat对象[#%E5%88%9B...
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单细胞 | 单细胞数据格式转换：Converting from loom/h5ad to Seurat最近看到Fly Cell Atlas (FCA) 公布果蝇的多个组织的单细胞核转录组测序数据，虽然FCA组织提供了多个在线平台（例如SCope）...
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技术 | 单细胞转录组测序之Microwell-seq最近在看Construction of a human cell landscape at single-cell level 一文中，作者构建...
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