MAKER注释教程 - 文集

MAKER注释教程

5篇文章 · 6224字 · 3人关注

使用MAKER进行注释: 如何避免多轮MAKER时的重复运算
通常而言，我们会运行不只一轮的MAKER。如果参考组序列没有变化，那么有一些计算只需要做一次就行了，例如将EST, Repeat和Protein...

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使用MAKER进行注释: 训练SNAP基因模型
准备阶段训练SNAP模型，需要准备三个文件，分别是参考基因组序列，组装的转录本序列和同源蛋白序列。对于参考基因组序列，我们要保证N50需要超...

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使用MAKER进行注释: 输出基因模型的人工检查
使用MAKER运行结束后可以使用Jbrowse对基因模型进行可视化。由于MAKER和JBrowse同属于GMOD项目，因此能够很方便的输出结果转...

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使用MAKER进行注释: 学习MAKER的配置参数
MAKER配置文件详解本文翻译自http://weatherby.genetics.utah.edu/MAKER/wiki/index.php...

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使用MAKER进行注释: 理解的MAKER的并行化
MAKER并行分为两种，一种基于MPI，运行方式为mpiexec -n 线程数 maker, 一种是在同一个项目中运行多次maker。前者需要在...

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