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    seurat-PrepSCTFindMarkers源码解析

    一、FindAllMarkers()函数报错 最近事情太多,好久没有写简书,断更很久,惭愧。前几天,将服务器的seurat包升级到4.1.0版本...

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    seurat-FindAllMarkers()源码解析

    现在回想单细胞项目的一些常规分析,clusters/groups间的差异表达分析(differential expression analysi...

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    如何优雅的阅读Seurat包

    20211109(周二)1.今天准备学习scanpy单细胞分析包,走在路上想,我用seurat和scanpy的意义在哪里,多学一个软件吗?学习软...

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    seurat-SCTransform()解析-01

    satijalabsctransform包的github网址:https://github.com/ChristophH/sctransform...

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    seurat-ScaleData()源码解析

    一、ScaleData()简介 单细胞基因表达counts矩阵数据经过NormalizeData()归一化处理后,还需要进行scale标准化。S...

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    seurat-NormalizeData()源码解析

    年底复盘,发现很多知识点理解并不深入,想对这些不清晰的知识点重新梳理一下。 一、NormalizeData()归一化 考虑到文库测序深度的影响,...

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    seurat-AverageExpression()源码解析

    前段时间,一个单细胞分析同行提问,发现AverageExpression()和通过aggregate计算得到的基因表达均值,两者的结果是不一样的...

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