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    非模式物种KEGG富集数据库准备(二)

    一、KEGG数据下载 1、先进入官网:https://www.kegg.jp/[https://www.kegg.jp/] 2、进入KO (KE...

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  • KEGGREST使用方法

    一、介绍 KEGG[https://www.kegg.jp/kegg/] 是一个数据库资源,用于从分子水平信息,特别是基因组测序和其他高通量产生...

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    非模式物种GO富集数据库准备(一)

    当我们需要做非模式物种的富集时,进行查询后也没有对应的数据,那么需要我们自己准备。那就需要这个物种的基因组数据fasta 和gtf 文件自行构建...

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    kobas安装

    一、自行下载安装: 进入kobas官网[http://bioinfo.org/kobas]点击下载,对应的安装包和数据库。 二、conda 安装...

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    GO富集结果进行图形绘制

    怎么将得到的Go富集[https://www.jianshu.com/p/638c4e3fba35]的结果进行可视化呢?本文使用ggplot2进...

  • 非模式物种GO富集分析(clusterProfiler)

    自备的GO库,使用R clusterProfiler做GO富集非模式物种和数据库中没有的物种要做GO分析怎么办呢?现自己准备一个文件作为数据库...

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