，即非度量多维尺度分析（NMDS analysis and plot NMDS），是一种将多维空间的研究对象（样本或变量）简化到低维空...

安装、加载R包 加载数据 OTU差异分析 1、构建DESeqDataSet对象 2、差异分析 3、提取分析结果 4、统计结果 5、合并数据 设置...

    LEfSe（LDA Effect Size）分析是一种用于发现和解释高维度数据生物标识（基因、通路和分类单元等）的分析工具。在微生物分析...

    PCA，即主成分分析（Principal Component Analysis），是一种考察多个变量间相关性的降维统计方法，其原理是设法...

    之前文章中我们讲到过冗余分析（redundancy analysis, RDA），今天我们来讲另一种分析——典范对应分析（canonic...

    此前文章中小编已经给大家介绍了微生物群落组成多样性分析的三大主要板块——Alpha多样性分析、Beta多样性分析及群落结构组成分析。然而...

    偏最小二乘法判别分析，即我常说的PLS-DA（Partial Least Squares Discriminant Analysis），...

    之前有一位粉丝后台留言说能不能出一期有关于共线性网络的文章，说实话，小编之前只在文献中看到过这类图，对于其原理也是迷迷糊糊。看了好多别人...

引言     上一期内容我们介绍了基于R语言对微生物丰度进行计算并进行可视化，今天这期内容主要介绍如何使用热图（Heatmap）来展示物种丰度的...