2025年单细胞空间系列课程

2025年的培训马上就要开始了~~~~

课表如下：

第一课：单细胞多样本基础分析梳理

第二课：单细胞亚群注释与个性化分析梳理

第三课：10X visium（Stereo-seq bin > 50） 多样本基础分析梳理

第四课：单细胞空间联合分析（RCTD、cell2location、iStar、spotiphy）

第五课：10X visium（Stereo-seq bin > 50）多样本细胞niche与注释

第六课：10X visium（Stereo-seq bin > 50） 空间转录组（单样本/多样本）共定位分析

第七课：10X visium（Stereo-seq bin > 50） 空间通讯分析

第八课：10X visium（Stereo-seq bin > 50）空间CNV分析

第九课：10X visium（Stereo-seq bin > 50）hotspot分析

第十课：10X visium（Stereo-seq bin > 50）细胞轨迹分析

第11课：10X HD （Stereo-seq bin < 50、slide-seq）基础分析梳理

第12课：10X HD （Stereo-seq bin < 50、slide-seq）依据邻域识别空间域与多样本整合

第13课：10X HD （Stereo-seq bin < 50、slide-seq）空间注释

第14课：10X HD （Stereo-seq bin < 50、slide-seq）细胞niche分析

第15课：10X HD （Stereo-seq bin < 50、slide-seq）共定位与邻域分析

第16课：10X HD （Stereo-seq bin < 50、slide-seq）细胞邻域差异富集分析

第17课：10X HD （Stereo-seq bin < 50、slide-seq）通讯分析

第18课：关于10X HD （Stereo-seq bin < 50）个性化分析的讨论（CNV、轨迹、NMF等）

第19课：Xenium（CosMx、IMC等高精度平台）基础分析梳理与细胞网络

第20课：Xenium（CosMx、IMC等高精度平台）依据邻域空间聚类与数据增强

第21课：Xenium（CosMx、IMC等高精度平台）RCN（Recurrent cellular neighborhoods）分析

第22课：Xenium（CosMx、IMC等高精度平台）细胞邻域与共定位

第23课：Xenium（CosMx、IMC等高精度平台）细胞邻域差异分析

第24课：Xenium（CosMx、IMC等高精度平台）依据微环境区分细胞亚型

第25课：Xenium（CosMx、IMC等高精度平台）细胞邻域通讯分析

第26课：CODEX基础分析梳理

第27课：CODEX数据CN聚类

第28课：CODEX数据邻域相关内容分析

大致课程如上，可能有1~2节课的波动，对于过去课程讲过的内容，重点部分我们进行复习，没有更新的就不多讲了，有更新的话我们补充一下。

初步计划6月21号开始上第一课。

2025学员会在课前拉一个微信群，把一部分近一年总结的一些分析资料、脚本发群里，供大家课前学习。

报名链接2025年单细胞空间系列课程

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