clusterProfiler挑选背景集做GO富集

我们一般在利用clusterProfiler做GO富集的时候，往往都是默认用全部基因集去当背景集去做的，由于富集分析的假设检验利用的是fisher检验，传送门：fisher检验

因此，我们利用GO函数：

ego <- enrichGO(
          gene  = gene$entrzID,
          keyType = "ENTREZID", 
          universe = names(geneList), #背景基因集
          OrgDb   = org.Hs.eg.db,
          ont     = "CC",
          pAdjustMethod = "BH",
          pvalueCutoff  = 0.01,
          qvalueCutoff  = 0.05,
          readable      = TRUE)

利用参数universe来指定背景集的基因，如果没加则代表默认采用全部基因作为背景集

参考：https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/12159139.html