「r<-workshop」第二期:程序控制与数据操作流

推荐图书

R 编程基础

内容:

  • 基础语法
  • 控制与循环结构
  • 函数与包
  • 数据读取和保存
    • read.*write.*
    • loadsave
    • readRDSsaveRDS

数据操作流程

  • 放本小抄在身边,随时查阅

Tidyverse

  • https://github.com/tidyverse/

  • 数据导入 read_*

  • 管道 %>%

    • x %>% f(y) > f(x, y)
  • 筛选

    • 行筛选 slice, filter, sample_n, sample_frac, top_n, distinct
    • 列筛选 select
      • contains
      • num_range
      • starts_with
      • ends_with
      • one_of
      • matches
    • 排序 arrange
  • 行列增加/更新

    • mutate, transmute
    • mutate_
    • add_row
    • add_column
    • rename
    • rownames_to_column, column_to_rowname
    • 向量化函数
      • 基本的数学和比较逻辑运算符 + - * / > < ==
      • 偏移 dplyr:: lag lead
      • 聚合 dplyr:: cumall cumany cummax cummean cummin cumprod cumsum
      • 排序 dplyr:: cume_dist dense_rank min_rank ntile percent_rank row_number
      • 其他 dplyr:: between case_when coalesce if_else na_if pmax pmin recode recode_factor
  • 汇总

    • 简单汇总
      • count
      • summarize
    • 分组汇总 group_by, ungroup
    • 汇总函数
      • 计数 dplyr:: n n_distinct base::sum(!is.na())
      • 位置 mean, meadian
      • 逻辑值 mean, sum
      • 位置 dplyr:: first last nth
      • 排序 quantile min max
      • 分布 IQR mad sd var
  • 合并

    • bind_rows
    • bind_cols
    • semi_join
    • anti_join
    • left_join, right_join, inner_join, full_join
    • intersect
    • setdiff
    • union
    • setequal 辅助查看两个数据集是否相同(不管行序)
  • 变异动词 (_at, _if, _all)

    • filter_*
    • select_*
    • summarize_*
    • arrange_*
    • ...
  • 字符处理

    • substr
    • stringr包与正则表达式略微复杂,可以单独讲一次
  • 转换 tidyr

    • Tidy 数据格式



    • tibble

    • tribble, enframe

    • as_tibble, is_tibble

  • 缺失值

    • drop_na
    • fill
    • replace_na
  • 长转宽 pivot_wider, spread

  • 宽转长 pivot_longer, gather
  • 拓展表格

    • expand
    • complete
  • 分割和连接

    • separate
    • separate_rows
    • unite
  • 数据导出

    • write_*

data.table 与 base

  • 数据导入 fread
  • 数据导出 fwrite
  • data.table 语法 dt[i, j, by]
  • 数据过滤与合并等操作与 R 基础语法一致,也可以使用 tidyverse 处理
    • 整数索引
    • 逻辑索引
    • 命名索引
  • 进一步的学习参考小抄、文档和《R 语言编程指南》

后几期主题

本期未讲述的内容???

  • 正则表达式与字符串处理:basestringr
  • 列表处理与迭代计算: purrr
  • 统计建模: statsbroom
  • 绘图:graphicsggplot2
  • 函数编程:apply家族和purrr

开发:

  • devtools
  • usethis
  • testthat
  • roxygen2 与 roxytest
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