九象限图
1. 九象限图的作用
在多组学分析中，九象限图具有以下重要作用：
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综合展示多组学数据关系
多组学分析涉及多个层面的数据，如基因组学、转录组学、蛋白质组学等。九象限图可以将不同组学的数据同时展示在一个图形中，让研究人员能够直观地看到各个组学变量之间的关系。例如，将基因表达水平、蛋白质丰度和代谢物浓度等数据分别映射到不同的坐标轴上，通过九象限图可以快速发现哪些基因的表达变化与特定蛋白质的丰度变化以及代谢物的浓度变化相关联。
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识别关键生物标志物
通过九象限图可以筛选出在多个组学层面上都具有显著变化的变量，这些变量很可能是关键的生物标志物。比如，在疾病研究中，如果某个基因在基因组学上存在突变，同时其对应的转录本在转录组学中表达量显著改变，并且相关蛋白质在蛋白质组学中也有明显的丰度变化，那么这个基因及其相关产物就有可能成为潜在的疾病生物标志物。
2. 九象限图的含义
如图，为转录组和代谢组联合分析的九象限图。
图的横轴和纵轴分别是两个组学的差异表达结果的log2FoldChange值，表示在各自组学中的差异表达倍数。
九个象限的含义如下：
| 象限 | 含义 | 颜色 |
|---|---|---|
| 1,3,7,9 | 在两组学均差异表达的点（如基因/代谢物） | 蓝色 |
| 2,8 | 在其中一个组学（代谢组）差异表达，而在另一个组学表达无显著性差异 | 绿色 |
| 4,6 | 在其中一个组学（转录组）差异表达，而在另一个组学表达无显著性差异 | 红色 |
| 5 | 在两组学表达均无无显著性差异，这部分一般会被忽略 | 黑色 |
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