linux 环境配置和conda的初步使用
参考公众号—生信技能树和生信星球
# miniconda3软件下载成功
#-c 指的是断点续传
bash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh
# 遇到yes/no输入yes,其他直接enter搞定
source ~/.bashrc
conda --help
# miniconda2安装成功,并成功配置好环境变量
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
# 配置镜像成功
conda create -n rna python=2
# 创建小环境成功,并成功安装python2版本
# 每建立一个小环境,都要装一个python=2的软件作为依赖
source activate rna
# 成功激活进入小环境,即可安装软件
conda install -y fastqc
# 出现三个done,即表示安装成功,否则重新提交命令
# install remove search update
fastqc --help
# 成功出现帮助文档,fastqc软件安装成功
conda install -y sra-tools
# 出现三个done,即表示安装成功,否则重新提交命令
prefetch --help
# 成功出现帮助文档,sra-tools软件安装成功
# 安装什么软件,并不等于调用什么命令--help
conda deactivate
# 成功退出rna小环境
# 或直接退出当前账户```