《学习小组Day5笔记--李济伟》

熟悉数据结构

1.标量和向量的区分

y<- c(1,2,3) #常用的向量写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。
y

y<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
y

y<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)
y

y<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
y
image.png

2.从向量中提取元素
2.1根据元素位置

#这里的x是你刚才赋值的变量名,根据自己的情况来修改
y[5] #x第5个元素
y[-5]#排除法,除了第5个元素之外剩余的元素
y[2:4]#第2到4个元素
y[-(2:4)]#除了第2-4个元素
y[c(1,5)] #第1个和第5个元素
image.png

2.2根据值

y[y==10]#等于10的元素
y[y<0]
y[y %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素
image.png

得好好理解%in%这个符号
3.数据框
(1)读取本地数据
(2)设置行名和列名
(3)数据框的导出
(4)变量的保存与重新加载

x <- read.table(file ="nodes.txt",sep = '\t',header = T)
head(x)
colnames(x)[1]<-"bioplanet" #有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
head(x)
y<-read.table(file = "nodes2.txt",sep = "   ",header =T,row.names=1)#最后
head(y)
write.table(y,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号) 
#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

(5)提取元素

 y[1,2]#第1行第2列
 y[1,]#第1行
 y[,3]#第3列
 y[3] #也是第y列
 y[1:2]#第1列到第2列
 y[c(1,2)]#第a列和第b列
 y$gene   列名#也可以提取列
```散点图因为没下载数据  算了 下次吧
记下代码

a <-data.frame(case=paste("S",1:50),values=runif(50))
plot(acase,avalues)

方法1:attach

将数据框名添加到搜索环境中:attach(a),作图时就只需输入列名(连$都不用了)。

attach(a)
plot(case,values)

方法2:with

with(a,{
 plot(case,values)
x<<-summary(values)   #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量,也就是出了大括号仍有效。
})
x #运行完后打印x

save没找到X,那重复赋值一下X,就可以了吧

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 221,888评论 6 515
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 94,677评论 3 399
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 168,386评论 0 360
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 59,726评论 1 297
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 68,729评论 6 397
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 52,337评论 1 310
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 40,902评论 3 421
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 39,807评论 0 276
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 46,349评论 1 318
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 38,439评论 3 340
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 40,567评论 1 352
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 36,242评论 5 350
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 41,933评论 3 334
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 32,420评论 0 24
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 33,531评论 1 272
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 48,995评论 3 377
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 45,585评论 2 359

推荐阅读更多精彩内容