熟悉数据结构

1.标量和向量的区分

y<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
y

y<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
y

y<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
y

y<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
y

image.png

2.从向量中提取元素
2.1根据元素位置

#这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改
y[5] #x第5个元素
y[-5]#排除法，除了第5个元素之外剩余的元素
y[2:4]#第2到4个元素
y[-(2:4)]#除了第2-4个元素
y[c(1,5)] #第1个和第5个元素

image.png

2.2根据值

y[y==10]#等于10的元素
y[y<0]
y[y %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

image.png

得好好理解%in%这个符号
3.数据框
（1）读取本地数据
（2）设置行名和列名
（3）数据框的导出
（4）变量的保存与重新加载

x <- read.table(file ="nodes.txt",sep = '\t',header = T)
head(x)
colnames(x)[1]<-"bioplanet" #有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
head(x)
y<-read.table(file = "nodes2.txt",sep = "   ",header =T,row.names=1)#最后
head(y)
write.table(y,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号） 
#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

（5）提取元素

 y[1,2]#第1行第2列
 y[1,]#第1行
 y[,3]#第3列
 y[3] #也是第y列
 y[1:2]#第1列到第2列
 y[c(1,2)]#第a列和第b列
 y$gene   列名#也可以提取列
```散点图因为没下载数据  算了 下次吧
记下代码

a <-data.frame(case=paste("S",1:50),values=runif(50))
plot(avalues)

方法1：attach

将数据框名添加到搜索环境中：attach（a）,作图时就只需输入列名(连$都不用了)。

attach(a)
plot(case,values)

方法2：with

with(a,{
 plot(case,values)
x<<-summary(values)   #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，也就是出了大括号仍有效。
})
x #运行完后打印x

save没找到X，那重复赋值一下X，就可以了吧