240 发简信
IP属地:甘肃
  • 根据已有序列提纯二三代测序数据

    提纯二代数据 提纯三代数据

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    FG12组装注释全过程

    测序: RNA-seq:100Xnanopore:80Xresequence:30X 质控: 使用fastp对RNAseq和Resequence...

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    数据表达定量

    比对软件:hisat2 比对率至少70% 饱和性曲线:20M reads数据量即可检测到80%数据量碱基数目:(150+150)X20M(r...

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    antiSMASH数据库:微生物次生代谢物合成基因组簇查询和预测

    临床上使用的大部分抗生素和药物均来自植物或微生物的天然产物。结合基因组挖掘的经典分离与分析法使得基于基因组的天然产物途径鉴定和描述更为方便。 a...

  • 2020-05-05使用SignalP对蛋白序列进行信号肽预测

    信号肽简介信号肽是蛋白质N-末端一段编码长度为5-30的疏水性氨基酸序列,用于引导新合成蛋白质向通路转移的短肽链。信号肽存在于分泌蛋白、跨膜蛋白...

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    禾谷镰刀菌转录组分析--准备数据

    1、准备数据:测序数据和参考基因组测序数据:NCBI中SRA数据库,Accession: PRJNA522013 ASPERA,类似下载加速器,...

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    2020-03-17

    合并矩阵: 输入:每个样本定量结果,输出:reads.count矩阵(gene_count.matrix)用于差异分析,标准化后的矩阵(tpm....

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    2018-09-03

    第一天 数据下载https://sra-explorer.info/? 流程:全部选中--add to collection--saved da...