学习小组Day3笔记--ksprings

学习小组Day3--Miniconda安装和使用.png

下载（选择最新的合适版本）

--2020-04-19 15:42:46--  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py38_4.8.2-Linux-x86_64.sh
Resolving mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn (mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn)... 101.6.8.193, 2402:f000:1:408:8100::1
Connecting to mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn (mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn)|101.6.8.193|:443... connected.
HTTP request sent, awaiting response... 200 OK
Length: 89817099 (86M) [application/octet-stream]
Saving to: ‘Miniconda3-py38_4.8.2-Linux-x86_64.sh’

Miniconda3-py38_4.8.2-Linux-x86_64.sh     100%[==================================================================================>]  85.66M  1.71MB/s    in 35s     

2020-04-19 15:43:21 (2.45 MB/s) - ‘Miniconda3-py38_4.8.2-Linux-x86_64.sh’ saved [89817099/89817099]

bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$ ls
Miniconda3-py38_4.8.2-Linux-x86_64.sh

安装bash

bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$ bash Miniconda3-py38_4.8.2-Linux-x86_64.sh 

Welcome to Miniconda3 4.8.2

In order to continue the installation process, please review the license
agreement.
Please, press ENTER to continue
>>> 
===================================
End User License Agreement - Anaconda Individual Edition
===================================

......
......

Do you accept the license terms? [yes|no]
==> For changes to take effect, close and re-open your current shell. <==

If you'd prefer that conda's base environment not be activated on startup, 
   set the auto_activate_base parameter to false: 

conda config --set auto_activate_base false

Thank you for installing Miniconda3!

激活source

bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$ source ~/.bashrc

添加镜像

(base) bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
(base) bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
(base) bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
(base) bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$ conda config --set show_channel_urls yes

使用

查看已安装软件 conda list

(base) bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$ conda list
# packages in environment at /home/bio05/miniconda3:
#
# Name                    Version                   Build  Channel
_libgcc_mutex             0.1                        main    defaults
asn1crypto                1.3.0                    py38_0    defaults
ca-certificates           2020.4.5.1           hecc5488_0    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
certifi                   2020.4.5.1       py38h32f6830_0    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
cffi                      1.14.0           py38h2e261b9_0    defaults
chardet                   3.0.4                 py38_1003    defaults
conda                     4.8.3            py38h32f6830_1    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda-package-handling    1.6.0            py38h7b6447c_0    defaults
cryptography              2.8              py38h1ba5d50_0    defaults
fastqc                    0.11.9                        0    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
font-ttf-dejavu-sans-mono 2.37                 hab24e00_0    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
fontconfig                2.13.1            h86ecdb6_1001    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
freetype                  2.10.1               he06d7ca_0    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
icu                       64.2                 he1b5a44_1    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
idna                      2.8                   py38_1000    defaults
ld_impl_linux-64          2.33.1               h53a641e_7    defaults
libedit                   3.1.20181209         hc058e9b_0    defaults
libffi                    3.2.1                hd88cf55_4    defaults
libgcc-ng                 9.1.0                hdf63c60_0    defaults
libiconv                  1.15              h516909a_1006    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
libpng                    1.6.37               hed695b0_1    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
libstdcxx-ng              9.1.0                hdf63c60_0    defaults
libuuid                   2.32.1            h14c3975_1000    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
libxml2                   2.9.10               hee79883_0    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
ncurses                   6.2                  he6710b0_0    defaults
openjdk                   11.0.1            h516909a_1016    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
openssl                   1.1.1f               h516909a_0    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
perl                      5.26.2            h516909a_1006    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
pip                       20.0.2                   py38_1    defaults
pycosat                   0.6.3            py38h7b6447c_0    defaults
pycparser                 2.19                       py_0    defaults
pyopenssl                 19.1.0                   py38_0    defaults
pysocks                   1.7.1                    py38_0    defaults
python                    3.8.1                h0371630_1    defaults
python_abi                3.8                      1_cp38    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
readline                  7.0                  h7b6447c_5    defaults
requests                  2.22.0                   py38_1    defaults
ruamel_yaml               0.15.87          py38h7b6447c_0    defaults
setuptools                45.2.0                   py38_0    defaults
six                       1.14.0                   py38_0    defaults
sqlite                    3.31.1               h7b6447c_0    defaults
tk                        8.6.8                hbc83047_0    defaults
tqdm                      4.42.1                     py_0    defaults
urllib3                   1.25.8                   py38_0    defaults
wheel                     0.34.2                   py38_0    defaults
xz                        5.2.4                h14c3975_4    defaults
yaml                      0.1.7                had09818_2    defaults
zlib                      1.2.11               h7b6447c_3    defaults

查找软禁 conda search
下载安装软件 conda install

(base) bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$ conda install -y fastqc
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done

删除软件 conda remove
更新软件 conda update
查看环境 conda info --envs
- 配置环境 conda create

(base) bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$ conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done

## Package Plan ##

  environment location: /home/bio05/miniconda3/envs/rna-seq

  added / updated specs:
    - fastqc
    - python=3
    - trimmomatic


The following packages will be downloaded:

    package                    |            build
    ---------------------------|-----------------
    _libgcc_mutex-0.1          |      conda_forge           3 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    _openmp_mutex-4.5          |            0_gnu         435 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    alsa-lib-1.1.5             |    h516909a_1002         544 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    giflib-5.2.1               |       h516909a_2          80 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    jpeg-9c                    |    h14c3975_1001         251 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    lcms2-2.9                  |       hbd6801e_1         406 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    ld_impl_linux-64-2.34      |       h53a641e_0         616 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    libffi-3.2.1               |    he1b5a44_1007          47 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    libgcc-ng-9.2.0            |       h24d8f2e_2         8.2 MB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    libgomp-9.2.0              |       h24d8f2e_2         816 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    libstdcxx-ng-9.2.0         |       hdf63c60_2         4.5 MB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    libtiff-4.1.0              |       hc7e4089_6         668 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    libwebp-base-1.1.0         |       h516909a_3         845 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    libxcb-1.13                |    h14c3975_1002         396 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    lz4-c-1.9.2                |       he1b5a44_0         223 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    ncurses-6.1                |    hf484d3e_1002         1.3 MB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    openjdk-11.0.1             |    h600c080_1018       172.1 MB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    pip-20.0.2                 |             py_2         1.0 MB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    pthread-stubs-0.4          |    h14c3975_1001           5 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    python-3.8.2               |he5300dc_6_cpython        70.8 MB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    readline-8.0               |       hf8c457e_0         441 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    setuptools-46.1.3          |   py38h32f6830_0         635 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    sqlite-3.30.1              |       hcee41ef_0         2.0 MB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    tk-8.6.10                  |       hed695b0_0         3.2 MB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    trimmomatic-0.39           |                1         142 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
    wheel-0.34.2               |             py_1          24 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-fixesproto-5.0        |    h14c3975_1002           8 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-inputproto-2.3.2      |    h14c3975_1002          18 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-kbproto-1.0.7         |    h14c3975_1002          26 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-libx11-1.6.9          |       h516909a_0         918 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-libxau-1.0.9          |       h14c3975_0          13 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-libxdmcp-1.1.3        |       h516909a_0          18 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-libxext-1.3.4         |       h516909a_0          51 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-libxfixes-5.0.3       |    h516909a_1004          17 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-libxi-1.7.10          |       h516909a_0          45 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-libxrender-0.9.10     |    h516909a_1002          31 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-libxtst-1.2.3         |    h516909a_1002          31 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-recordproto-1.14.2    |    h516909a_1002           7 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-renderproto-0.11.1    |    h14c3975_1002           8 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-xextproto-7.3.0       |    h14c3975_1002          27 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xorg-xproto-7.0.31         |    h14c3975_1007          72 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    xz-5.2.5                   |       h516909a_0         430 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    zlib-1.2.11                |    h516909a_1006         105 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    zstd-1.4.4                 |       h6597ccf_3         991 KB  https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    ------------------------------------------------------------
                                           Total:       272.3 MB

The following NEW packages will be INSTALLED:

  _libgcc_mutex      anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::_libgcc_mutex-0.1-conda_forge
  _openmp_mutex      anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::_openmp_mutex-4.5-0_gnu
  alsa-lib           anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::alsa-lib-1.1.5-h516909a_1002
  ca-certificates    anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::ca-certificates-2020.4.5.1-hecc5488_0
  certifi            anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::certifi-2020.4.5.1-py38h32f6830_0
  fastqc             anaconda/cloud/bioconda/noarch::fastqc-0.11.9-0
  font-ttf-dejavu-s~ anaconda/cloud/conda-forge/noarch::font-ttf-dejavu-sans-mono-2.37-hab24e00_0
  fontconfig         anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::fontconfig-2.13.1-h86ecdb6_1001
  freetype           anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::freetype-2.10.1-he06d7ca_0
  giflib             anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::giflib-5.2.1-h516909a_2
  icu                anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::icu-64.2-he1b5a44_1
  jpeg               anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::jpeg-9c-h14c3975_1001
  lcms2              anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::lcms2-2.9-hbd6801e_1
  ld_impl_linux-64   anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::ld_impl_linux-64-2.34-h53a641e_0
  libffi             anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::libffi-3.2.1-he1b5a44_1007
  libgcc-ng          anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::libgcc-ng-9.2.0-h24d8f2e_2
  libgomp            anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::libgomp-9.2.0-h24d8f2e_2
  libiconv           anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::libiconv-1.15-h516909a_1006
  libpng             anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::libpng-1.6.37-hed695b0_1
  libstdcxx-ng       anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::libstdcxx-ng-9.2.0-hdf63c60_2
  libtiff            anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::libtiff-4.1.0-hc7e4089_6
  libuuid            anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::libuuid-2.32.1-h14c3975_1000
  libwebp-base       anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::libwebp-base-1.1.0-h516909a_3
  libxcb             anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::libxcb-1.13-h14c3975_1002
  libxml2            anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::libxml2-2.9.10-hee79883_0
  lz4-c              anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::lz4-c-1.9.2-he1b5a44_0
  ncurses            anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::ncurses-6.1-hf484d3e_1002
  openjdk            anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::openjdk-11.0.1-h600c080_1018
  openssl            anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::openssl-1.1.1f-h516909a_0
  perl               anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::perl-5.26.2-h516909a_1006
  pip                anaconda/cloud/conda-forge/noarch::pip-20.0.2-py_2
  pthread-stubs      anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::pthread-stubs-0.4-h14c3975_1001
  python             anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::python-3.8.2-he5300dc_6_cpython
  python_abi         anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::python_abi-3.8-1_cp38
  readline           anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::readline-8.0-hf8c457e_0
  setuptools         anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::setuptools-46.1.3-py38h32f6830_0
  sqlite             anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::sqlite-3.30.1-hcee41ef_0
  tk                 anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::tk-8.6.10-hed695b0_0
  trimmomatic        anaconda/cloud/bioconda/noarch::trimmomatic-0.39-1
  wheel              anaconda/cloud/conda-forge/noarch::wheel-0.34.2-py_1
  xorg-fixesproto    anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-fixesproto-5.0-h14c3975_1002
  xorg-inputproto    anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-inputproto-2.3.2-h14c3975_1002
  xorg-kbproto       anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-kbproto-1.0.7-h14c3975_1002
  xorg-libx11        anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-libx11-1.6.9-h516909a_0
  xorg-libxau        anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-libxau-1.0.9-h14c3975_0
  xorg-libxdmcp      anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-libxdmcp-1.1.3-h516909a_0
  xorg-libxext       anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-libxext-1.3.4-h516909a_0
  xorg-libxfixes     anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-libxfixes-5.0.3-h516909a_1004
  xorg-libxi         anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-libxi-1.7.10-h516909a_0
  xorg-libxrender    anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-libxrender-0.9.10-h516909a_1002
  xorg-libxtst       anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-libxtst-1.2.3-h516909a_1002
  xorg-recordproto   anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-recordproto-1.14.2-h516909a_1002
  xorg-renderproto   anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-renderproto-0.11.1-h14c3975_1002
  xorg-xextproto     anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-xextproto-7.3.0-h14c3975_1002
  xorg-xproto        anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xorg-xproto-7.0.31-h14c3975_1007
  xz                 anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::xz-5.2.5-h516909a_0
  zlib               anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::zlib-1.2.11-h516909a_1006
  zstd               anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::zstd-1.4.4-h6597ccf_3



Downloading and Extracting Packages
libgomp-9.2.0        | 816 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-kbproto-1.0.7   | 26 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
setuptools-46.1.3    | 635 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-libxtst-1.2.3   | 31 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
zlib-1.2.11          | 105 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
libwebp-base-1.1.0   | 845 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-libx11-1.6.9    | 918 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
libxcb-1.13          | 396 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
pip-20.0.2           | 1.0 MB    | ########################################################################################################################## | 100% 
alsa-lib-1.1.5       | 544 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
lz4-c-1.9.2          | 223 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
giflib-5.2.1         | 80 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
ncurses-6.1          | 1.3 MB    | ########################################################################################################################## | 100% 
libgcc-ng-9.2.0      | 8.2 MB    | ########################################################################################################################## | 100% 
tk-8.6.10            | 3.2 MB    | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-xproto-7.0.31   | 72 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
wheel-0.34.2         | 24 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
_libgcc_mutex-0.1    | 3 KB      | ########################################################################################################################## | 100% 
pthread-stubs-0.4    | 5 KB      | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-renderproto-0.1 | 8 KB      | ########################################################################################################################## | 100% 
lcms2-2.9            | 406 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-libxfixes-5.0.3 | 17 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-fixesproto-5.0  | 8 KB      | ########################################################################################################################## | 100% 
python-3.8.2         | 70.8 MB   | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-libxi-1.7.10    | 45 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-libxau-1.0.9    | 13 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
libstdcxx-ng-9.2.0   | 4.5 MB    | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-inputproto-2.3. | 18 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
trimmomatic-0.39     | 142 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
ld_impl_linux-64-2.3 | 616 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
libtiff-4.1.0        | 668 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-libxdmcp-1.1.3  | 18 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
openjdk-11.0.1       | 172.1 MB  | ########################################################################################################################## | 100% 
libffi-3.2.1         | 47 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
jpeg-9c              | 251 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-libxext-1.3.4   | 51 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-recordproto-1.1 | 7 KB      | ########################################################################################################################## | 100% 
xz-5.2.5             | 430 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
zstd-1.4.4           | 991 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
_openmp_mutex-4.5    | 435 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-libxrender-0.9. | 31 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
sqlite-3.30.1        | 2.0 MB    | ########################################################################################################################## | 100% 
readline-8.0         | 441 KB    | ########################################################################################################################## | 100% 
xorg-xextproto-7.3.0 | 27 KB     | ########################################################################################################################## | 100% 
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
#
# To activate this environment, use
#
#     $ conda activate rna-seq
#
# To deactivate an active environment, use
#
#     $ conda deactivate

激活环境 conda activate

(base) bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$ conda activate rna-seq
(rna-seq) bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$

退出环境 conda deactivate

(rna-seq) bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$ conda deactivate 
(base) bio05@VM-0-10-ubuntu:~/biosoft$

移除环境 conda env remove

人面猴
序言：七十年代末，一起剥皮案震惊了整个滨河市，随后出现的几起案子，更是在滨河造成了极大的恐慌，老刑警刘岩，带你破解...
沈念sama阅读 214,658评论 6赞 496
死咒
序言：滨河连续发生了三起死亡事件，死亡现场离奇诡异，居然都是意外死亡，警方通过查阅死者的电脑和手机，发现死者居然都...
沈念sama阅读 91,482评论 3赞 389
救了他两次的神仙让他今天三更去死
文/潘晓璐我一进店门，熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来，“玉大人，你说我怎么就摊上这事。” “怎么了？”我有些...
开封第一讲书人阅读 160,213评论 0赞 350
道士缉凶录：失踪的卖姜人
文/不坏的土叔我叫张陵，是天一观的道长。经常有香客问我，道长，这世上最难降的妖魔是什么？我笑而不...
开封第一讲书人阅读 57,395评论 1赞 288
港岛之恋（遗憾婚礼）
正文为了忘掉前任，我火速办了婚礼，结果婚礼上，老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己，他们只是感情好，可当我...
茶点故事阅读 66,487评论 6赞 386
恶毒庶女顶嫁案：这布局不是一般人想出来的
文/花漫我一把揭开白布。她就那样静静地躺着，像睡着了一般。火红的嫁衣衬着肌肤如雪。梳的纹丝不乱的头发上，一...
开封第一讲书人阅读 50,523评论 1赞 293
城市分裂传说
那天，我揣着相机与录音，去河边找鬼。笑死，一个胖子当着我的面吹牛，可吹牛的内容都是我干的。我是一名探鬼主播，决...
沈念sama阅读 39,525评论 3赞 414
双鸳鸯连环套：你想象不到人心有多黑
文/苍兰香墨我猛地睁开眼，长吁一口气：“原来是场噩梦啊……” “哼！你这毒妇竟也来了？” 一声冷哼从身侧响起，我...
开封第一讲书人阅读 38,300评论 0赞 270
万荣杀人案实录
序言：老挝万荣一对情侣失踪，失踪者是张志新（化名）和其女友刘颖，没想到半个月后，有当地人在树林里发现了一具尸体，经...
沈念sama阅读 44,753评论 1赞 307
护林员之死
正文独居荒郊野岭守林人离奇死亡，尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋以下内容为张勋视角年9月15日...
茶点故事阅读 37,048评论 2赞 330
白月光启示录
正文我和宋清朗相恋三年，在试婚纱的时候发现自己被绿了。大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
茶点故事阅读 39,223评论 1赞 343
活死人
序言：一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡，死状恐怖，灵堂内的尸体忽然破棺而出，到底是诈尸还是另有隐情，我是刑警宁泽，带...
沈念sama阅读 34,905评论 5赞 338
日本核电站爆炸内幕
正文年R本政府宣布，位于F岛的核电站，受9级特大地震影响，放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜，却给世界环境...
茶点故事阅读 40,541评论 3赞 322
男人毒药：我在死后第九天来索命
文/蒙蒙一、第九天我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。院中可真热闹，春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
开封第一讲书人阅读 31,168评论 0赞 21
一桩弑父案，背后竟有这般阴谋
文/苍兰香墨我抬头看了看天上的太阳。三九已至，却和暖如春，着一层夹袄步出监牢的瞬间，已是汗流浃背。一阵脚步声响...
开封第一讲书人阅读 32,417评论 1赞 268
情欲美人皮
我被黑心中介骗来泰国打工，没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留，地道东北人。一个月前我还...
沈念sama阅读 47,094评论 2赞 365
代替公主和亲
正文我出身青楼，却偏偏与公主长得像，于是被迫代替她去往敌国和亲。传闻我的和亲对象是个残疾皇子，可洞房花烛夜当晚...
茶点故事阅读 44,088评论 2赞 352

学习小组Day3笔记--ksprings

下载（选择最新的合适版本）

安装bash

激活source

添加镜像

使用

推荐阅读更多精彩内容