合作文章|转录组 + WGCNA 联合解析:紫色小白菜芽花青素合成关键基因鉴定

文章信息

文章题目:Transcriptome and WGCNA Analyses Reveal Key Genes Regulating Anthocyanin Biosynthesis in Purple Sprout of Pak Choi (Brassica rapa L. ssp. chinensis)

文章主题:转录组与WGCNA揭示调控紫色小白菜芽花青素合成的关键基因

研究团队:贵州师范大学生命科学学院朱斌教授团队

组学技术:RNA-Seq

2 研究背景

本研究聚焦于紫色小白菜芽苗。该类芽苗因富含对人体有益的花青素而备受消费者青睐,市场潜力巨大。虽然花青素在多种作物中的合成机制已被广泛研究,但对于小白菜在芽苗(子叶)阶段花青素如何合成与调控,目前仍属未知。这一知识缺口限制了高营养价值紫色小白菜芽苗的进一步开发与利用。因此,本研究旨在系统揭示紫色小白菜芽苗中花青素生物合成的关键调控机制。

3 研究思路

研究结论

明确紫色小白菜芽 0-6 天的表型与花青素积累规律:1d 为花青素合成启动点,6d 含量达最高(0.52 mg/g FW);鉴定花青素合成的关键基因:正调控基因BraPAP2.A03、BraTT8.A09、BraDFR.A09、BraANS.A01,负调控候选基因BraMYBL2.A07;

揭示调控机制:早期以正调控为主驱动花青素合成,后期以负调控为主维持含量稳定,为紫色小白菜芽的品种改良与开发利用提供理论基础。

图1 不同发育阶段紫色小白菜芽的总花青素含量分析
图2 转录组测序结果
图3 华清合成相关基因热图
图4 WGCNA确定hub基因
图5 qRT-PCR验证
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